钩栗居群遗传多样性与遗传结构分析

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钩栗为壳斗科栲属常绿乔木,材质坚硬,属红锥类,分布广泛,是我国具有重要开发前景的珍贵用材树种。本文以湖南、湖北和福建的9个钩栗野生居群共111个样本的叶片为研究对象,利用ISSR分子标记的方法探讨了它们的遗传关系,评价了9个钩栗野生居群的遗传多样性及遗传结构,这为钩栗资源的搜集保存和开发利用提供了科学依据。结论如下:1.建立了钩栗ISSR-PCR最佳反应体系。即:20 μL反应总体系中,含30ng模板DNA,3mmol/L Mg2+,0.4mmol/LdNTPs,0.75UTaq DNA聚合酶,0.3μmol/L引物。2.筛选出了10条条带清晰多态性好且可用于遗传结构分析的多态性引物。利用100条引物分别对111份钩栗基因组DNA进行PCR扩增,共扩增出158条清晰条带,其中多态性条带141条,多态性条带百分率(P)平均为89.01%。每个引物扩增的条带数目在13-19条之间,平均每条引物扩增出15.1条条带。每个居群的多态性条带百分率在84.81%-93.67%之间,其中周宁居群最低,永顺居群最高。3.钩栗居群具有较高的遗传多样性和变异度。数据分析发现钩栗9个居群间遗传分化系数(Gst)为0.1855,这表明遗传变异大部分存在于居群内,即居群内的遗传变异占总变异量的81.45%。基因流(Nm*)为2.1960,Nm*>1,结果显示,钩栗居群间的基因流水平可以防止遗传漂变的作用,降低局部产生的变异,维系居群间的相似性。Nei’s基因多样性指数、Shannon’s信息指数、总种群基因多样度(Ht)、各种群基因多样度(Hs)分别为0.3323、0.4920、0.4108、0.3346,综合各项参数说明钩栗居群具有较高的遗传多样性和变异度。4.钩栗居群地理距离的远近是影响居群遗传变异的主要因素。聚类分析结果表明,采自福建的邵武、建瓯、建阳、屏南和周宁居群聚在一起;恩施和桑植居群聚在一起;永顺和浏阳居群聚为一起,种群遗传变异分布模式基本上与其地理生态格局一致。各居群间的遗传距离差异较大,其中,邵武与建瓯居群的遗传距离最近,仅为0.0815;浏阳和周宁居群的遗传距离最远,为0.1984。5.环境因子中的坡位、年降水量、经度及纬度是影响钩栗遗传多样性的主导因子。环境因子的相关性与9个钩栗种群的遗传多样性检测中,环境因子里的海拔和年平均气温与钩栗种群的各遗传多样性参数呈现负相关关系,说明它们之间存在微弱的相关关系,在一定程度上影响了钩栗种群间的基因交流;坡位、年降水量、经度及纬度与各遗传多样性指数呈现明显的正相关关系,表明坡位、年降水量、经度及纬度等因子是影响钩栗遗传多样性的主导因子。
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