大白菜(Brassica rapa L.var.pekinensis)属十字花科芸薹属叶用蔬菜,起源于中国,分布面积广,占我国蔬菜栽培面积较广。大白菜是一种种子春化型和绿体春化型的二年生植物,一般在夏末和秋季种植。为实现全年供应的需求,春季种植也逐渐发展起来。然而,大白菜在早春低温加上长日照,会使其通过春化,并加速抽薹开花,从而使大白菜失去商品价值。另一方面,春化促使大白菜快速抽薹开花可以加快繁殖速度,加倍繁育出优良品种。因此,低温春化对大白菜生长发育影响需要进行详细的研究工作。本研究选取两种耐抽薹性大白菜,对其苗期进行春化和长日照处理,固定长日照和春化温度参数,梯度春化时间,选取关键时期进行转录组测序。对分析得出的基因进行自组织特征图(SOM)和加权基因共表达(WGCNA)分析,筛选出与春化相关的关键基因为大白菜春化作用的研究奠定基础。具体研究成果如下:1.转录组测序读取了974,584,922数据,总共291.28Gb。与大白菜参考基因组对比,鉴定出了44,799个已知基因和2,280个新基因。2.在两个大白菜材料转录组测序结果中筛选出21,035个差异表达基因进行SOM分析。分析表明,与植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢、光周期和生物钟以及春化途径有关的差异基因在两个大白菜不同的春化时期均发生了显著变化。此外,TPS,UGP,CDF,VIN1和七个激素途径的基因在春化过程中具有不同表达模式,可以作为大白菜春化候选基因。3.对转录组测序基因进行低丰度和低变异性过滤,筛选出两个大白菜的5748和5527个基因进行WGCNA分析,构建两个基因共表达网络,揭示了不同处理下的共表达模块。发现多糖代谢在春化过程中可能促进芽系统形态发生;碳水化合物的代谢,几丁质的响应,以及脱落酸和乙烯激活的信号传导途径可能是大白菜花期转化的重要生物学功能;BBX32、SUS1、PAO、TSF和NAC029作为hub基因且具有促进花发育的生物功能,且在两种大白菜的春化过程中具有不同的表达模式,可以作为大白菜春化候选基因。4.对SOM和WGCNA分析得出的关键基因进行实时荧光定量PCR检测,表达趋势与测得转录组数据一致,证明了数据的可靠性与可用性。同时这些基因在两种大白菜的春化处理下的不同表达揭示了不同的春化机制。