随着计算机相关技术的迅速发展，医院信息系统(HIS)已经成为医院不可或缺的一种快速、高效、准确的管理工具和手段。目前的医院信息系统着重于医院业务流程的重组与实现，而医院管理决策者更希望计算机能够对在信息系统建设过程中积累的大量历史数据进行整合和数据分析，更多地参与决策支持，而不再是对数据简单的收集、整理、查询和统计。为了提高分析和决策的效率和有效性，必须把分析数据从事务处理环境中提取出来，按照决策支持系统处理的要求进行重新组织，建立单独的分析处理环境，数据仓库正是为了构建这种新的分析处理环境而出现的一种数据存储和组织技术。建立医院数据仓库系统有现实意义，也是医院信息系统进一步发展的必然结果。 本文主要研究在现有的医院信息系统数据库的基础上，应用数据仓库技术、联机分析技术和数据挖掘技术，结合统计分析模型，建立了初具规模的医院信息系统数据仓库，探讨了医院信息系统中数据查询不准确问题和历史数据查询问题；利用OLAP技术和统计模型，对引入数据仓库的数据进行分析和应用，根据决策者的需求，设计了十八个不同的主题，并在此基础上建立了基于医院信息系统的数据仓库系统，使医院信息系统成为了医院决策者可信赖的决策依据平台。