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非同义单核苷酸多态性(Non-synonymous Single Nucleotide Polymorphisms,nsSNPs)可改变氨基酸的序列,形成单氨基酸多态性(Single Amino acid Polymorphisms,SAPs)并导致蛋白功能的改变。尽管国内外研究已经预测了许多潜在与磷酸化/激酶相关的单氨基酸多态性(phosphorylation related SAPs,pSAPs)位点,但目前这些预测的pSAPs蛋白序列还基本未验证过,且它们的特征和功能的研究并不充分。本研究从多角度系统挖掘了pSAPs及它们的编码基因表达特征及功能作用。根据先前通过质谱数据验证过的SAPs和已知的磷酸化信息,我们鉴定到了847个高可信度的pSAPs,其中涉及到814个不同的变异蛋白。这些pSAPs具有690个编码基因,而且这些基因在GTEx(Genotype-Tissue Expression)数据集中的27种不同正常组织中广泛表达,其中一部分在特定的组织中显著富集高表达。接着,我们探索了pSAPs影响蛋白磷酸化修饰的方式,并系统分析pSAPs变异对蛋白功能的影响,结果显示90%的pSAPs编码基因在TCGA(The Cancer Genome Atlas)的20种不同癌症中都表现出显著的差异表达和/或与患者的存活率紧密关联。此外,我们还在这些pSAPs编码基因中鉴定到了一些与癌症显著相关的潜在候选标志物(如KIF15,CCNB1等),以期帮助病人进行癌症的诊断和预后情况的预测。最后,我们构建了蛋白质相互作用网络,并解析了pSAPs对信号通路的潜在调节作用,尝试阐述了其中的可能疾病机制。总的来说,本研究基于鉴定到高可信pSAPs系统研究了pSAPs编码基因的表达及功能,并深入分析了pSAPs编码基因在不同癌症中对病人预后的影响,可望进一步促进癌症的诊断和治疗。