【摘 要】
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真核生物的核糖体发生是一个极其复杂而精密的过程,约有两百多个组装因子参与其中。其中90S核糖体前体,又称小亚基加工体,是最早形成的一个巨大复合物,完整的90S约有5兆道尔
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真核生物的核糖体发生是一个极其复杂而精密的过程,约有两百多个组装因子参与其中。其中90S核糖体前体,又称小亚基加工体,是最早形成的一个巨大复合物,完整的90S约有5兆道尔顿的分子量。利用冷冻电镜单颗粒技术,我们解析了接近完整的酵母90S的结构,分辨率从8.7?至4.5?。其中在Mtr4敲除的样品中得到了4.5?最高分辨率的样品。结合已知晶体结构、同源模型和化学交联质谱数据,我们搭建了大部分蛋白因子的结构模型,包括36种组装因子和19种核糖体小亚基蛋白;手动搭建了5’ETS RNA的10个双螺旋区中的8个;18S RNA的部分则是在成熟18S的基础上修正。本文按5’ETS蛋白(UTP-A、UTP-B、U3snoRNP)、5’ETS RNA、18S 5’结构域、central结构域、3’major结构域、3’minor结构域的顺序,分区域描述90S的结构。在我们的90S模型中可以看到UTP-A、UTP-B以相似的α螺旋束形成的异源四聚体;U3 RNA与5’ETS RNA和18S有四个互补位点,其中最后一个位点是首次发现;18S的各个结构域都已经部分形成,但是相对位置与成熟40S中存在较大差别。测试了90S加工过程中两个RNA解旋酶Dhr1和Mtr4对90S结构的影响。在Dhr1敲除的样品中,我们观察到了90S的三种状态。除了正常的状态以外,还有两种5’ETS RNA被降解的两种状态,并结合生化和质谱的证据,确定了Mtr4募集exosome组分在降解5’ETS RNA方面的直接作用。在5’ETS RNA被降解后,90S仍然可以保持整体轮廓,尤其是5’ETS蛋白仍然结合在90S上,证明了5’ETS RNA降解和90S的解体是两个相对独立的过程,90S至40S的加工步骤要比现有的模型更加复杂。
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