4个位点单核苷酸多态性与冠心病易感相关性研究

来源 :延边大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liangzi_li1
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冠心病是最常见的心血管疾病之一,是由环境因素和遗传因素相互作用引起的一类复杂性多基因遗传性疾病。近年来,随着基因测序技术突飞猛进的发展以及越来越广泛的应用,单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisma,SNP)已成为医疗技术研究的热点。尤其自2007年以来,全基因组关联研究(genome-wideassociation study,GWAS)已发现与冠心病发病相关的多个多态性位点,为冠心病的易感人群及患者的预防、诊断及治疗提供了新的依据。但这些多态性位点对不同的人群冠心病的影响尚不清楚,大多数位点影响冠心病发生的机制尚不明确。本文根据GWAS的研究结果筛选出了rs515135、rs1122608、rs6544713、rs216172这四个位点进行冠心病基因单核苷酸多态性研究。与这四个位点相关的基因分别为APOB基因,LDLR基因,ABCG5-ABCG8基因,SMG6基因。  目的:  本研究目的在于对延边汉族人群rs515135、rs1122608、rs6544713、rs216172四个单核苷酸多态性位点进行分析,探讨这四个SNPs位点的等位基因频率、基因型频率与冠心病易感性的相关性,同时研究SNPs位点与临床各参数的相关性,从而为进一步明确延边汉族人群冠心病的发病机制、评估冠心病病变程度以及判断冠心病预后提供新的治疗目标。  方法:  1.研究对象  本文采用病例对照研究方法,收集延边地区汉族冠心病患者及其同期年龄、性别相匹配的正常汉族人群共405例。其中病例组标本204例,选自2014年3月至2015年11月的汉族冠心病患者,其在延边大学附属医院心血管内科确诊并住院治疗,年龄34-81岁,平均年龄64.7±9.9岁,男119例,女85例。选择同期在延边大学附属医院体检科健康体检的汉族正常人群为对照组,共201例,年龄50-88岁,平均年龄64.8±9.3岁,男111例,女90例。  2.候选基因和SNPs位点的选择  本文研究意在根据GWAS在冠心病易感性中的研究结果.同时结合查阅大量相关文献,共筛选出rs515135、rs1122608、rs6544713、rs216172这四个位点进行研究。  3.SNPs位点检测方法  采用基于荧光标记单碱基延伸原理的SNaPshot技术进行SNP的分型检测,检测过程主要包括引物设计合成、DNA提取、预扩增、预扩增产物纯化、延伸反应、延伸产物纯化,最后上机检测进行数据分析。  结果:  (1)临床参数  冠心病组204例,平均年龄64.7±9.9岁,其中男119例,女85例。正常对照组共201例,平均年龄64.8±9.3岁,男111例,女90例。两组别之间高血压、吸烟史、HDL、LDL有统计学意义(P<0.05),而年龄、性别、BMI、收缩压、舒张压、糖尿病史、TG、TC无统计学意义。  (2)Hardy-Weinberg平衡检验  APOB基因rs515135位点、LDLR基因rs1122608位点、SMG6基因rs216172位点这3个SNP均符合Hardy-Weinberg平衡检验,表明本研究所选取的样本具有较好的群体代表性。  (3)冠心病组与对照组之间的相关分析结果  ①两组间等位基因频率的相关分析:LDLR基因的rs1122608位点的等位基因频数在冠心病组和对照组之间有显著的统计学差异(P=0.005,P<0.01)  ②两组间基因型频率的相关分析:SMG6基因的rs216172位点的三种基因型频率在冠心病组和对照组之间有统计学差异(P=0.009,P<0.05),说明该位点与冠心病有关联。  ③两组间基因模型模拟的基因型频率的相关分析:通过模拟基因模型,当SMG6基因的rs216172位点的等位基因G为显性遗传时,在GC+GG型与CC型两组之间有显著性差异(P=0.004,P<0.01)。  (4)不同基因型间临床参数的比较  对这4个SNP位点在BMI、收缩压、舒张压、TC、TG、HDL、LDL间比较,统计分析应用单因素方差分析,所得结果4个SNP位点的不同基因型间在这些临床参数均无统计学意义。  (5)4个SNP位点与心肌梗死的相关分析  APOB基因的rs515135位点的三种基因型频率在MI组和非MI组两组之间有统计学差异(P=0.047,P<0.05),说明该位点与MI有关联。  (6) CAD相关的危险因素分析  rs216172、高血压、LDL与冠心病的发病风险相关(P<0.05),有统计学差异;而OR值分别为1.479、1.737、1.782,是冠心病的危险因素。  结论:  对于延边地区汉族人群中实验研究结论:  1.SMG6基因的rs216172位点(C/G)与冠心病的发病有相关性,其CC基因型可能对冠心病发病起保护性作用。  2.LDLR基因的rs1122608位点(G/T)的T等位基因是冠心病的保护性基因。  3.APOB基因的rs515135位点(G/A)与心肌梗死发病相关联,其GG基因型可能是心肌梗死发病的保护性因素。  4.ABCG5/ABCG8基因的rs6544713位点未发现与冠心病的相关性。  5.rs216172、高血压、LDL与冠心病的发病风险相关,是冠心病的危险因素。
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