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柱花草(Stylosanthesspp.)是我国南方区域具有较高经济价值的当家牧草。本研究以双亲在重要性状上差异较大的1979柱花草(S.guianensisTPRC 1979) (♀)与品45柱花草(S.g ianensisTPRCR 273 ) ( (?) )进行杂交,F1杂种自交,建植了202株F2代分离群体,对亲本、F1和F2代群体进行了农艺学性状、抗旱性和耐盐性等指标观测分析。利用全基因组测序构建了首张高密度SNP遗传图谱,并进行柱花草重要性状的初步定位。本研究的主要结果如下:(1)构建SNP遗传图谱。通过Joinmap4.1软件构建了共10个连锁群含有1543个SNP标记的柱花草遗传连锁图谱,总覆盖遗传距离为1854.5716cM,标记间平均距离为1.2cM,这是目前柱花草标记数量最多,密度最高的遗传连锁图谱。(2)对F2构图群体进行农艺性状观测。延续2015年课题组农艺性状的测定,于2016年对F2构图群体产量相关农艺性状包括自然株高、幅宽、鲜干比、叶长、宽、一级分枝数、最长枝以及单株鲜重等进行了测定。结果表明,这9个农艺性状的平均变异系数是33.62%,其中鲜、干重变异系数最大。正态性检验表明6个农艺性状符合正态分布。相关性分析、回归分析和主成分分析表明,对产量造成最大影响的是一级分枝数,其次是株高,均产生了正向作用。(3) F2代作图群体的苗期抗逆性分析。柱花草F2分离群体分别进行了抗旱性和耐盐性研究,两种胁迫选取相同的7个逆境指标进行测定分析,以相对值反映其在逆境条件下的适应能力。聚类分析结果表明,水分胁迫下的160份柱花草材料、盐分胁迫下的83份材料以及两种胁迫下的61份材料均表现出一定的杂种优势,耐逆境能力强的株系占总体的60%以上。(4)柱花草形态学性状、品质性状和农艺性状的QTL定位。结合遗传图谱,利用MapQTL5软件的定位结果可知,与形态学性状相关联的共检测到77个,其中阈值=3时控制花色和初花期的均有14个位点,阈值=9时控制盛花期的有49个位点。与品质性状相关联的QTLs共检测到157个,其中以阈值=3为标准的QTLs有:控制粗蛋白含量的有6个,控制粗纤维含量的有5个,控制粗脂肪含量的有20个,控制粗灰分含量的有27个,控制镁含量的有15个;以阈值=5为标准的QTLs有:控制钙含量的有27个,控制磷含量的有28个,控制钾含量的有29个。与10个农艺性状相关联的QTLs检测到481个,其中控制单株鲜重的有74个,控制干重的有1个,控制自然株高的位点有40个,控制最长枝的有6个,控制一级分枝数的有34个,控制主茎分枝数的有50个,控制叶长的有59个位点,控制叶宽的有61个,控制幅宽的位点仅有1个,控制鲜干比的有155个。