三江源国家生态保护综合试验区位于青海省南部,属于青藏高原气候变化的敏感区,也是青海省少数民族的聚居区。三江源的自然环境不但关系到省内各民族同胞的安居乐业,甚至影响全国的生态环境和社会的可持续发展。纵观过去的几十年,三江源的生态环境逐渐退化,土地呈现荒漠化态势、水土流失等问题不断加剧。在此背景下,对三江源国家生态保护综合试验区进行生态健康评价和生态补偿标准的研究就显得尤为重要。本研究利用遥感影像数据、景观数据、气象数据和社会经济统计数据,结合目前通用的生态健康评价模型(P-S-R模型)构建评价指标体系,进行试验区县域生态健康评价;运用CASA模型估算NPP,计算得出试验区的景观价值,最终以各县所处生态健康水平为依据制定补偿调整系数,得到试验区的生态补偿标准。本研究得出了以下两个主要结论:(1)2010到2014年,三江源国家生态保护综合试验区生态系统整体维持初步健康水平,其中海南藏族自治州整体生态健康水平呈下降态势,大部分区域由亚健康水平转向不健康水平;黄南藏族自治州整体生态健康水平略有下降,但始终以健康水平为主;果洛藏族自治州整体生态健康水平呈上升态势,始终以健康和很健康水平为主;玉树藏族自治州整体生态健康水平呈下降态势;海西蒙古族藏族自治州的唐古拉山镇的生态健康水平显著提高。(2)三江源国家生态保护综合试验区的补偿标准为341.97×108元,其中治多县的补偿标准最高为66.57×108元,尖扎县的补偿标准最低为2.13×108元。将生态补偿尺度扩展到州县级别,得到海南藏族自治州的生态补偿值为45.01×108元;黄南藏族自治州的生态补偿值为22.59×108元;果洛藏族自治州的生态补偿值为74.45×108元;玉树藏族自治州的生态补偿值为173.4×108元,海西蒙古族藏族自治州的唐古拉山镇的生态补偿值为26.52×108元。