社会经济发展到今天，科技创新已经成为第一影响要素。而全社会科技创新的基础在县域，在县域科技创新系统中，有多种影响因素，包括政府、企业、中介、科研院所、高校等，那么县域科技创新中的政府这一个重要的要素该如何发挥其职能，以构建合理有效的创新体系，推动县域科技创新是本文讨论的主要内容。　　确定县域科技创新中政府的职能，就要弄清楚在县域科技创新中，政府应该做什么和不应该做什么的问题。在这之前，要弄清楚在县域科技创新中市场的作用，也就是市场能做什么和不能做什么。县域科技创新系统中存在政府、企业、中介、科研院所、高校等诸多要素，市场通过影响各要素的发展来影响整个县域的科技创新发展，市场的需求和本身的竞争特性对县域科技创新具有基础性的资源配置作用。市场为科技创新带来了基础和活力，市场的需求带来了科技创新的基本动力，减少了科技创新的不确定性，促进了各创新要素之间的沟通与联系。但市场因为存在垄断、无法提供公共物品、外部效应等问题，会导致科技创新资源配置上的低效，影响区域内的产业结构调整和恶性竞争，对科技创新起到负面影响，不能发挥县域内创新资源的最有效利用。基于政府和市场的关系，政府的职能便是为了给市场提供其发挥作用的条件，同时要解决市场失灵的问题，政府为市场提供维持公平竞争的政策和法律法规，使市场处于良性竞争中，政府通过科技项目计划适度干预科技创新方向，协调好各创新要素之间的关系，构建完善的创新体系。政府应该从制定创新战略、培育创新主体、优化创新环境、提供公共物品等方面入手，实现科技创新资源的有效配置，并提供公共产品和公服务如科技创新平台等，完善科技创新系统中的各个要素。　　为进一步提出政府在促进科技创新的职能发挥上的具体建议，本文以利津县为例，通过实地调研、调查问卷等方式，分析利津县科技创新现状、促进科技创新中政府职能发挥，总结出利津县在发挥政府职能上主要存在战略规划不完善、创新环境营造乏力、资金投入不足、公共服务缺失等问题，结合这些问题及前文关于政府职能定位的研究成果，通过借鉴江苏省常熟市和福建省晋江市在推动科技创新上的先进经验，常熟市主要在加大资金投入、抓好政策执行、做好公共服务几个方面上发挥政府职能，而晋江市则通过转变政府服务理念、科技创新宣传与氛围营造、精准政策制定几个方面推动本地科技创新，提出县域科技创新中，政府主要发挥以下职能，优化科技创新环境、培育创新主体、加大科技创新财政投入、做好公共服务。