21世纪,随着知识经济快速的发展,科学技术已成为推动社会进步、发展的“第一生产力”,对社会经济的发展发挥了越来越重要的作用。世界各国之间的竞争也日益体现在科技水平的强弱上,衡量一国经济与综合国力的关键因素之一就是科学技术水平,因此科研逐渐成为了人类社会中的重大事业之一。由于世界上各个国家对科学研究的高度重视,科研院所的科研资金与资源的投入也迅猛增长,政府开始高度重视科研经费的使用及科研相关资源的高效利用,社会各界也对此广泛关注,加快创建现代财政制度,建立全面规范透明、标准科学、约束有力的预算制度,与推进国家治理体系和治理能力现代化休戚相关,加强对科研院所科研投入产出的评价成为迫切需要解决的问题。本文首先综述国内外绩效评价及平衡计分卡的研究动态,然后深入分析麻类研究所现有预算绩效管理以及预算绩效评价体系所存在的问题及原因。其次,以先进的绩效评价理念为基础,以麻类研究所的战略目标为导向,分析了构建基于平衡计分卡的绩效评价体系的必要性和可行性。再次,将平衡计分卡理论作为绩效评价的主要方法,将麻类研究所的战略目标从具体到财务、客户与评价、内部业务流程、学习与成长四个层面,并针对单位具体情况对各层面指标进行调整,建立出了绩效评价指标体系,然后运用层次分析法来计算和确定各指标的权重。并对绩效评价的预期实施效果进行了预测,为了确保平衡计分卡绩效评价体系的长期顺利实施,提出了相应的保障措施。新体系的建立,能更加全面、科学、系统的评价麻类研究所的预算绩效水平,有效的平衡了麻类研究所的财务、非财务指标以及短期和长期目标。这一绩效考核体系具有更高的使用价值,有利于麻类研究所的全面发展,为单位的绩效考核提供了新的方法和思路,并可以对正引入平衡计分卡或计划引入平衡计分卡来进行绩效考核的科研事业单位提供一定的借鉴作用。