水质恶化使湄公河下游流域生态问题已被沿岸四个国家列为优先考虑的问题。本文着重讨论由水质变化带来的三个特定问题，如来自金边的城市废水和工业废水对生态带来的潜在影响；来自万象的城市废水和工业废水对生态带来的潜在影响；还有在湄公河三角洲水质日益下降对生态的影响。风险评价这个词是用来描述和估算事件发生不良后果的可能性的一种方法和技术，风险往往是指灾害发生可能造成危险的后果及其发生的概率。目前许多人倡议运用生态风险评价技术来为河流生态问题(如营养化、环境流量、生物栖息地、沉积物、外来物种)提供一个研究框架。因此，生态风险评价是一种可以评价多重因素影响下的复杂生态系统的一个很具吸引力的工具，这正适合用来评估湄公河流域状况。本文采用风险评价体系来对上述这些问题进行评价，特别是用来对湄公河流域生态安全的关键问题进行风险评估分析(如，富营养化问题、有毒物质含量和溶解氧引发的问题和生态过程问题)，也对水质影响鱼类迁徙的问题进行风险评估，同时还对水质影响人类健康(饮用水和其他生活用水的安全)的问题进行风险评估。但是，目前缺乏足够的数据来对湄公河下游水质问题带来生态问题做出充分的评估。本文的目的，就是通过对现有的数据和资料的分析，来确定湄公河下游的主要城市金边和万象市区污水排放对下游生态真正的或潜在的影响，以及对湄公河三角洲地区水质影响进行评价；如果因为缺乏足够的数据或资料，造成目前的评估仍未有定论，那么将会提出具体的方法和措施来做出确切的评估；并向湄公河委员会建议采取步骤，来监测这篇论文所分析的现实的或潜在的问题。本文对金边，万象和湄公河三角洲的水质问题带来的生态风险进行了初步评估。目前，在所有的评估案例中，得出结论的评估风险都比较低。虽然评估表明湄公河下游水质带来的生态风险很低，但从局部来看，事实并非如此。尤其是金边地区，由于水质测量显示化学耗氧量相对较高和溶解氧较低，初步评估显示，在洞里萨里河和巴塞河上游，水质问题对生态和人类健康存在着中度到高度的风险。在靠近金边两个地点的COD相对较高，反映了金边地区存在着有机污染；同时溶解氧偏低，也反映了从金边流出的雨水和污水对河流造成污染。