论文部分内容阅读
猪A型塞内卡病毒(Senecavirus A,SVA)是一种新出现的可导致猪特发性水疱病(Porcine idiopathic vesicular disease,PIVD)的小RNA病毒。SVA近年来流行于巴西、加拿大、美国和中国等国家,其临床症状与口蹄疫相似,引起各国养猪业的高度重视,然而其致病机理仍不明确。本研究以PK15细胞为研究对象,利用荧光定量PCR以及Western Blot等技术首次探究SVA感染后,ssc-miR-1285对RIG-I信号通路中关键分子的调控及其靶基因的作用。研究结果如下:(1)原核表达并纯化SVA-VP1蛋白,对制备的SVA-VP1单克隆抗体进行Western Blot验证与IFA筛选,得到6株杂交瘤细胞株,最终筛选出编号为3和13的单克隆抗体,对后续研究ssc-miR-1285调控RIG-I信号通路研究提供一定的基础。(2)通过miRNA高通量测序筛选出11个差异表达的miRNAs,其中7个miRNAs与RIG-I信号通路相关,4个呈现出上调的趋势、3个呈现出下调的趋势。qRT-PCR方法检测PK15细胞感染SVA后miRNA的相对表达量,结果与高通量测序结果中的趋势一致,其中,ssc-miR-1285极显著上调(P<0.01)。(3)与对照组相比,ssc-miR-1285相对表达量随着SVA感染时间的增加而上调,12 h、18 h、24 h差异显著(P<0.05);随着SVA接毒剂量的增加,MOI=1、MOI=5时ssc-miR-1285相对表达量上调显著(P<0.05);过表达/抑制ssc-miR-1285后,以SVA MOI=1的剂量分别感染PK15细胞48 h和72 h,TaqMan-RT-PCR和TCID50检测结果显示,相比于对照组,过表达或抑制ssc-miR-1285对SVA基因组的复制与对照组相比差异不显著(P>0.05),而SVA拷贝数在72 hpi较24 hpi组均有增长的趋势,但差异不显著(P>0.05);过表达ssc-miR-1285对SVA TCID50有抑制的趋势,但差异不显著(P>0.05)。(4)MOI=0.1/1/5/10的SVA感染PK15细胞3 h/6 h/9 h/12 h/18 h/24 h后,IFN-βmRNA表达量随SVA接毒剂量和感染时间的提高而显著上调(P<0.05);通过ELISA方法研究MOI=1时,SVA感染PK15细胞上清中IFN-β的分泌量,结果显示,与对照组相比,PK15细胞上清中的IFN-β分泌量在12 h、18 h显著上调(P<0.05),其他时间点差异不显著(P>0.05);与对照组相比,过表达ssc-miR-1285显著抑制IFN-β转录(P<0.05),抑制ssc-miR-1285时则显著促进IFN-β转录(P<0.05);当感染SVA 24 h后,过表达ssc-miR-1285显著促进IFN-β表达(P<0.05),抑制ssc-miR-1285后IFN-βmRNA显著下调(P<0.05)。(5)流式细胞仪监测PK15细胞周期结果显示,相比于对照组,过表达ssc-miR-1285 48 h时可显著促进细胞生长与增殖(P<0.05)。(6)过表达ssc-miR-1285后检测RIG-I信号通路关键分子mRNA的结果显示,相比于对照组,MAVS、TRAF3、IRF3、IRF7显著下调(P<0.05),而TANK、TKB1则有上调的趋势,但差异不显著(P>0.05);(7)结合生物信息学方法预测ssc-miR-1285靶位点、荧光定量RT-PCR、Western Blot、双荧光素酶活性等方法验证其作用靶基因,结果显示,ssc-miR-1285靶基因为DDX3X;合成3对DDX3X干扰RNA,通过qRT-PCR筛选出沉默效果较好的一对si-DDX3X;(8)沉默DDX3X的表达后检测RIG-I信号通路关键分子的mRNA表达情况,结果发现,相对于对照组,沉默DDX3X时显著抑制MAVS、TRAF3、IFN-β转录水平的表达(P<0.05),而MDA5、TANK、TKB1的转录水平则被显著促进(P<0.05)。本研究通过探索ssc-miR-1285及其靶基因之间的内在联系,为miRNA调控SVA感染的分子机制打下基础,为SVA的防控提供新的思路和方法。