正常态和激活态雪旺细胞与轴突再生相关基因甲基化差异的实验研究

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【目的】雪旺细胞(Schwann cells,SCs)是周围神经系统中最重要的细胞之一。成熟的SCs包裹神经元的轴突形成髓鞘,此时的SCs称为正常态雪旺细胞(Normal Schwann cells,NSCs)。周围神经损伤后,损伤远端神经纤维的轴突和髓鞘均被破坏,继而完全崩解,这种现象被称之为华勒变性。神经损伤后SCs即表现出高生物活性,此时的SCs称之为激活态雪旺细胞(Activated Schwann cells,ASCs),ASCs的高生物活性对轴突再生有良好的促进作用。然而,目前的研究绝大部分都集中在蛋白质水平和miRNA水平,并且大量的研究已经证实:ASCs和NSCs在蛋白质水平和miRNA水平存在显著差异,但是两种状态SCs存在差异的根本原因尚不清楚。近些年随着基因工程技术的逐渐成熟,DNA甲基化的研究越来越受到研究者重视,并且研究发现:周围神经系统损伤后,可使部分基因(如Shh和Olig1)发生甲基化状态改变,这些基因的甲基化改变对轴突再生起到关键作用。然而,目前还没有全基因组的比较ASCs和NSCs与轴突再生相关基因甲基化差异的实验研究。本课题通过DNA甲基化免疫共沉淀测序(Methylated DNA immunoprecipitation sequencing,MeDIP-Seq)技术检测Wistar大鼠ASCs和NSCs全基因组的甲基化差异,筛选轴突再生相关基因,并做功能分析。【方法】健康成年Wistar大鼠(约150±5克)3只,坐骨神经预损伤,臂丛神经仅做分离。饲养7天后,脱颈处死Wistar大鼠,提取坐骨神经损伤远端和臂丛神经各1.5厘米,采用低浓度胰蛋白酶消化法从坐骨神经组织提取ASCs、从臂丛神经提取NSCs。分别培养ASCs和NSCs至第3代,S-100抗体免疫荧光染色鉴定细胞,并计算细胞纯度。CCK8法测定细胞增殖,并绘制ASCs和NSCs的增值曲线。收集第3代ASCs和NSCs,使用EDTA方法提取DNA。运用MeDIP-Seq技术筛选出ASCs和NSCs的差异性甲基化区域;使用KOBAS软件对差异甲基化区域注释和统计分析,筛选出轴突再生相关差异甲基化基因,使用InterProScan软件分析差异基因的染色体分布情况、基因本体(GO)分析以及信号通路分析。【结果】本研究获得纯度为95%以上的ASCs和NSCs,两者S-100免疫荧光染色均表达阳性。在相同培养条件下,ASCs生长速度和贴壁速度更快。MeDIP-Seq共发现177176个差异性甲基化区域,其中位于启动子(≤1 kb)内1 097个、启动子(1~2 kb)内1 136个,CpG岛内567个。基因注释分类后,共获得214个与轴突再生相关的差异甲基化基因。这些基因分布于各个染色体上,以12号染色体上最多(22个),M染色体最少(2个)。GO分析结果显示差异甲基化基因涉及轴突生长、轴突形成、轴突延伸和轴突导向等过程;并且与MAPK、细胞黏附分子和Ras等信号通路有关。【结论】ASCs和NSCs的甲基化水平存在明显的差异,214个甲基化差异基因与轴突再生有关,分布于各个染色体上;涉及轴突生长、轴突形成、轴突延伸和轴突导向等过程,并且与MAPK、细胞黏附分子和Ras等主要信号通路有关。
其他文献
目的:通过观察多柔比星肾病大鼠血、尿生化指标、病理改变及足细胞相关蛋白Ezrin和NEPH1的表达,探讨足细胞损伤在大鼠多柔比星肾病发生发展中的作用及泼尼松对肾组织的保护作