绿豆慢生根瘤菌的多样性研究

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:haofan555888
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本研究采用表型性状测定、16S rDNA-RFLP、16S rDNA序列分析、16S-23S rDNA IGS RFLP分析以及RAPD分析等技术系统首次研究了从我国不同地域分离的44株绿豆根瘤菌的遗传多样性及其在根瘤菌系统发育中的地位和相互关系。 表型聚类结果可以看出:在84%的相似性水平上,44株供试根瘤菌和参比菌株可分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ三个群。在78%的水平上各群可进一步划分为不同的亚群:群Ⅰ分为1和2两亚群,是由13个分别来自于连云港、石家庄以及一株邯郸的未知菌组成;群Ⅱ分为3和4两个亚群。亚群3主要由来自连云港和邯郸的菌株组成,还包括Bradyrhizobium japonicumUSDA110;亚群4由来自新疆和四川等地的菌株和参比菌株Bradyrhizobium liaoningense 2281共同组成;群Ⅲ主要由来自南方如广东和广西的菌株组成,他们与参比菌株Bradyrhizobium elkanii USDA76、USDA46、USDA86聚在一起。 16S rDNA PCR-RFLP分析表明:在76%的相似水平上,所有供试菌株可分为三大类群;群Ⅰ由LYG1等13株慢生根瘤菌组成,该群在系统发育上与B. japonicum和B. liaoningense的参比菌株存在一定的差异;群Ⅱ由XJ1等21株供试菌株、B.japonicum和B.liaoningense的代表菌株组成;群Ⅲ由10株来自广东和广西的菌株和B. elkanii的代表菌株组成。 16S-23S rDNA IGS PCR-RFLP分析将供试菌株分为A、B两大群。群A由34株供试菌株、B.japonicum和B.liaoningense的代表菌株组成。在85%的相似性水平上,可再分为AⅠ、AⅡ和AⅢ三个亚群;群B由10株分离自广西和广东的菌株和B.elkanii的代表菌株组成。在85%的相似性水平上,可再分为BⅠ和BⅡ两亚群,表现出一定的多样性。与16S rDNA PCR-RFLP相比,16S-23S rDNA IGS PCR-RFLP具有更高的解析度,供试菌株表现出更加丰富的遗传多样性。分离自我国新疆、广东和广西等地的菌株在分群上具有较为明显在地域特征。 RAPD分析结果表明:在89%的相似性水平上,所有供试绿豆根瘤菌和参比菌株可分为a、b、c、d、e、f和g共7个亚群,提供了较高的解析度。并且从结果可以看出和表型聚类、16S rDNA PCR-RFLP以及16S-23S rDNA IGS RFLP的聚类结果均保持了较高的一致性。同时地理因素对根瘤菌的分群有较大的影响。
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