【摘 要】
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沙门菌是重要的人兽共患病原菌之一,是造成全球食源性疾病的重要病原菌之一,每年在全世界范围沙门菌病大约会发生9380万例。至今,世界上发现了超过2600种血清型,一些沙门菌血清型的流行爆发在造成巨大经济损失和健康威胁的同时,它的感染治疗问题对于沙门菌的防控提出了更高的要求。而近年报道发现的肯塔基沙门菌就是这样的一个高风险特征的沙门菌血清型,它具有高环丙沙星耐药和快速的人源和动物源菌株的交叉流行。国内
【基金项目】
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十三五国家重点研发计划,重要食源性致病菌耐药机制及传播规律研究项目子课题(2017YFC1600101); 畜禽国家重点研发计划,重要人畜共患食源性病原微生物在动物养殖和屠宰过程中的风险监测和防控技术研究(2018YFD0500500); 广州市珠江新星科技项目,基于CRISPR-Cas系统研究耐头孢菌素沙门菌耐药质粒的传
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沙门菌是重要的人兽共患病原菌之一,是造成全球食源性疾病的重要病原菌之一,每年在全世界范围沙门菌病大约会发生9380万例。至今,世界上发现了超过2600种血清型,一些沙门菌血清型的流行爆发在造成巨大经济损失和健康威胁的同时,它的感染治疗问题对于沙门菌的防控提出了更高的要求。而近年报道发现的肯塔基沙门菌就是这样的一个高风险特征的沙门菌血清型,它具有高环丙沙星耐药和快速的人源和动物源菌株的交叉流行。国内关于肯塔基沙门菌还并未建立系统的研究,所以关于中国肯塔基沙门菌的研究对其在我国的食源性致病菌的监管和防控有着重大的意义。本研究对2013年到2016年我国人源的临床病例和家禽供应链环节中分离的191株肯塔基沙门菌进行了药物敏感性分析和耐药分子特征性研究。药物敏感性结果表明,我国肯塔基沙门菌多重耐药率高达79.63%,其中肯塔基沙门菌对人类临床一线用药环丙沙星和头孢噻肟表现出耐药性,其耐药率分别为39.27%和7.85%。通过多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)对191株肯塔基沙门菌进行分析,发现我国肯塔基沙门菌的存在多样性,流行情况较为复杂。结果共发现8个ST型,其中ST314(n=117)和ST198(n=67)占主导。另外,ST152这类在美国家禽中常见的肯塔基菌株和奶牛中报道的肯塔基ST17菌株在中国也均有发现。通过多位点序列分型后对耐药性整理发现,我国分离的ST314和ST198肯塔基沙门菌在环丙沙星和头孢噻肟耐药率上有着较大的差异。研究对其喹诺酮耐药性的喹诺酮类耐药决定区(QRDR)突变情况和质粒介导喹诺酮耐药基因(PMQR)携带情况进行了检测。其中ST198肯塔基沙门菌的喹诺酮类耐药决定区(QRDR)的突变率较于ST314要高出许多。另外,ST198肯塔基沙门菌喹诺酮类耐药决定区的突变多样化(双突变,三突变)更为复杂。ST314肯塔基沙门菌检测结果主要体现在质粒介导喹诺酮耐药基因(PMQR)的携带。实验也对其头孢类药物的耐药问题进行了探讨,通过ESBLs基因型检测发现,bla TEM-1是主要的ESBLs基因(16/191,8.38%),其次是bla CTX-M-55(6/191,3.14%)和bla OXA-1(3/191,1.57%)。在ESBLs基因多样性和检出率方面肯塔基ST198沙门菌要高于肯塔基ST314沙门菌。研究采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法研究沙门菌同源性关系,对主要出现在我国的ST314和ST198肯塔基沙门菌株进行PFGE分型后,发现其主要呈现出2大聚类共38个PFGE亚型,其中15个PFGE亚型只包含单个聚合体,有23个PFGE亚型由2~53个聚合体构成。PFGE结果显示,我国分离的ST314和ST198肯塔基沙门菌中存在着家禽食品来源和人源菌株PFGE图谱高度同源性。综上所述,我国流行的肯塔基ST型复杂但主要以肯塔基ST198和肯塔基ST314菌株为主,其广泛分布于人、家禽和食品当中,存在着喹诺酮和头孢噻肟的耐药性以及人、家禽和食品之间跨来源传播的风险。并且不同ST型肯塔基沙门菌之间存在不同的喹诺酮耐药机制,其中ST198菌株的喹诺酮耐药性的产生的主要原因是由于其喹诺酮类耐药决定区(QRDR)的突变所致;ST314菌株的喹诺酮耐药性的产生是质粒上喹诺酮耐药基因(PMQR)介导的结果。本研究希望通过对于肯塔基沙门菌的分子流行病学研究为该疾病的预防监控提供可靠的数据支持和有效的参考意见。
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