自改革开放以来，我国的高技术产业得到快速发展，到2011年，总产值已经居于世界前列，但是在R&D投入强度等指标方面仍落在许多国家之后。在国家现代化发展进程中，经济增长的重要动力和绩效来自于高技术产业中R&D投入及其贡献。因此，从宏观区域环境与微观企业不同层面做系统深入研究具有重要意义。　　本文通过我国高技术产业30个省、自辖市2007-2012年的经济数据，结合目前对高技术产业已有的研究，将总产值利税率作为衡量产出绩效的指标，将企业R&D投入变量作为层—1自变量，各省地方财政支出中科技财政支出的比重作为层—2自变量，结合状态空间模型和多层贝叶斯模型进行R&D绩效分析。最终得到的结论是:1.我国R&D投入对产出的影响存在延迟效应2.我国高技术产业的产出效应不仅与R&D投入有关，还受到环境因素的影响。3.从纵向发展方面来看，随着时间的变动，我国高技术产业的总产值利税率有显著的正向增长效应。4.企业层面的R&D投入和各省的环境因素通过多种机制影响高技术产业的产业效应。　　本文的主要创新有以下几个方面:　　1.根据面板数据的特征，选用了纵向发展模型来研究我国高技术产业的R&D绩效，引入反映高科技产业发展的先验分布，估计了系统模型的固定效应和随机效应。　　2.根据面板数据的特征，同时结合状态空间模型和多层贝叶斯模型，首次运用分层贝叶斯模型来分析我国高技术产业的R&D效应。在分析两个层面的影响因素时，不仅考虑了水平2的环境因素对R&D投入因素与产出效应关系的调节机制，还考虑了R&D投入因素对产出总效应的自我调节机制。　　3.从宏观、微观及动态发展三个视角系统深入地研究了我国高技术产业的R&D绩效。在研究我国高技术产业的R&D绩效时，同时考虑了企业的R&D投入因素和高技术产业发展的环境因素。模型中，将产出效应对R&D投入的回归系数设定为可变系数，并且通过状态空间模型的拟合，得到了各省系数的发展趋势。