LncRNA AFAP1-AS1诱导肾癌对舒尼替尼耐药的功能及分子机制研究

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目的:研究LncRNA AFAP1-AS1诱导肾癌对舒尼替尼耐药中的功能及分子机制方法:利用与肾癌生长、转移、耐药性密切相关的241种LncRNA的SAM文库,使用CRISPR/dCas9方法构建慢病毒介导的SAM文库基因上调的载体,通过包装病毒、感染和舒尼替尼药物筛选,获得耐舒尼替尼的SAM文库上调的人肾细胞癌细胞(RCC)。RT-PCR方法检测SAM文库中各基因的表达,筛选出与舒尼替尼耐药相关的基因AFAP1-AS1。在RCC细胞系中利用CRISPR/dCas9上调AFAP1-AS1基因表达,并验证其耐药性。选择AFAP1-AS1周围1MB的编码RNA,使用RT-PCR方法检测对比AFAP1-AS1基因上调前后RCC细胞中上述基因表达,分析AFAP1-AS1基因与RCC舒尼替尼耐药的机制。利用蛋白印迹(Western-Blot)技术研究AFAP1-AS1基因上调前后相关蛋白的表达,寻找AFAP1-AS1基因与RCC舒尼替尼耐药的可能分子机制。结果:本研究将241SAM文库利用慢病毒感染技术感染肾癌细胞769-P,得到肾癌769-PSAM 241+。利用舒尼替尼筛选得到769-PSAM 241+舒尼替尼耐药株,并对其进行验证。使用RT-PCR的方法比较实验组(769-PSAM 241+舒尼替尼耐药株)与对照组(普通769-PSAM 241+细胞)中241个LncRNA相对表达,挑选出了7种明显上调且稳定表达的LncRNA,考虑其可能与肾癌769-P细胞对舒尼替尼耐药相关。取其中上调效果最明显的LncRNA AFAP1-AS1进一步研究,继而通过CCK8进行增殖实验验证其耐药性。Western-blot结果提示AKT信号通路及细胞的保护性自噬在AFAP1-AS1导致RCC对舒尼替尼耐药过程中起到了重要作用。siRNA敲低肾癌细胞中的AKT表达,敲减AKT后肾癌细胞对于舒尼替尼的耐药性发生了明显的逆转现象。此外,我们通过UCSC数据库寻到LncRNA AFAP1-AS1上下游共1MB的编码基因,利用RT-PCR及Western-blot技术,我们发现HTRA3及AFAP1在实验组与对照组中有明显变化,HTRA3可能是LncRNA AFAP1-AS1的下游机制,值得进一步研究。结论:AFAP1-AS1在RCC细胞中表达上调后,可导致AKT信号通路发生依赖性激活,AKT信号通路介导了AFAP1-AS1对RCC细胞舒尼替尼耐药的诱导过程。AFAP1-AS1在RCC细胞表达上调促进了RCC细胞的保护性自噬,促进了RCC细胞HTRA3蛋白的过表达,意味着保护性自噬及HTRA3蛋白可能参与AFAP1-AS1对RCC细胞舒尼替尼耐药的诱导过程。AFAP1-AS1能诱导RCC细胞发生耐药,发挥促癌作用,提示AFAP1-AS1可作为RCC靶向治疗预后判断因子及逆转舒尼替尼耐药的一个新靶点。
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