随着大气压离子源技术的不断发展,质谱已被广泛地应用于各种研究领域中,尤其在药物分析领域,其作用更加突显。本论文应用大气压离子源串联质谱技术对头孢菌素、4（3H）-喹唑啉酮、α-羟基烯酮三类药物活性分子的碎裂机理进行了探讨和研究,建立了这三类化合物的质谱裂解规律,并与传统电子轰击离子源下的裂解机理进行了比较。首先,采用电喷雾多级串联质谱技术,比较研究了头孢菌素类药物在碱金属离子与质子诱导下的裂解规律。发现在两种不同的离子诱导方式下的质谱行为多数都与侧链取代基相关;C（3）位侧链上的C-X（X=O、N、S）键是最容易断裂的部位;C（2）位羧基上的CO₂和C（8）位的CO也很容易脱去。与质子化离子的断裂相比,碱金属离子能诱导更多更复杂的断裂反应。其次,对4（3H）-喹唑啉酮类和α-羟基烯酮类两个系列药物活性分子在大气压化学电离源及电子轰击离子源下的质谱裂解规律进行了系统研究,着重比较了取代基类型及位置对化合物裂解途径的影响。结果发现药物活性分子在不同离子源下的断裂机理有显著差异。此外,质谱图中还表现出表征取代基丢失的特征碎片离子及由于甲基的邻位效应产生的特征离子,通过这些离子可以确定取代基的类型及位置。