【摘 要】
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RNA聚合酶Ⅱ(Pol Ⅱ)所介导的基因转录可以分为转录起始、转录延伸和转录终止等阶段。近年来,随着正性转录延伸因子b(Positive-Transcription Elongation Factor b,P-TEFb)的发现,转录延伸调控引起了研究者越来越多的关注。由激酶 Cyclin Dependent Kinase 9(CDK9)和 Cyclin T1(CycT1)组成的基础转录因子P-TE
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RNA聚合酶Ⅱ(Pol Ⅱ)所介导的基因转录可以分为转录起始、转录延伸和转录终止等阶段。近年来,随着正性转录延伸因子b(Positive-Transcription Elongation Factor b,P-TEFb)的发现,转录延伸调控引起了研究者越来越多的关注。由激酶 Cyclin Dependent Kinase 9(CDK9)和 Cyclin T1(CycT1)组成的基础转录因子P-TEFb,可以通过磷酸化Pol Ⅱ最大亚基CTD上的第二位丝氨酸,拮抗负性转录延伸因子的抑制作用,将Pol Ⅱ从暂停状态中释放出来,刺激转录延伸的高效进行。由于P-TEFb扮演着重要的作用,其功能受到一系列正性和负性因子的调节,组成了一张复杂而灵活的P-TEFb网络,包括:(1)活性受抑制状态的7SK snRNP复合体;(2)与另一个转录延伸因子ELL2共同组成超级转录延伸复合体SEC;(3)Brd4-P-TEFb复合体。为了更加全面完整地认识P-TEFb的网络组成及其功能,寻找其他潜在的新的结合因子的工作仍在继续,但进展缓慢。因此,对已知蛋白的深入挖掘,比如对翻译后修饰位点的鉴定以及功能的研究,将有助于我们更加深刻理解P-TEFb的调控机制。本论文对P-TEFb亚基之一 CycT1的多聚ADP核糖基化修饰(PARylation)进行鉴定分析,并对该修饰对P-TEFb功能以及转录延伸活性展开研究。我们发现CycT1的PARylation修饰依赖于CycT1的HRD区域,并对P-TEFb促进转录延伸的活性具有抑制作用。首先,CDK9、CycT1、ELL1和ELL2这几个起关键作用的转录延伸因子中,只有CycT1发生了 ADP核糖基化修饰。进一步的研究表明,CycT1发生的是两类ADP核糖基化修饰之一的PARylation,且该修饰是由PARP1这个ADP核糖基化转移酶介导的。同时,PARP1修饰CycT1也在体外修饰实验中得到了验证。随后,我们发现CycT1的修饰与其433-533区域相关,并且这段区域内的HRD结构域是该修饰所依赖的。另外,无论将HRD结构域内的组氨酸突变成不带电荷的丙氨酸、还是同样带正电荷的赖氨酸或者精氨酸,都降低P-TEFb的转录活性,同时阻碍CycT1发生PARylation。受上述结论启发,我们接着发现PARP1选择正在参与转录的那部分P-TEFb作为目标底物。进一步的研究表明发生自身修饰的PARP1能够以一种依赖于CycT1-HRD的方式结合CycT1,并与CycT1一起发生相位分离(Phase Separation),PARP1与CycT1因此共同聚集在所形成的液滴(Liquid Droplets)中,这可能是PARP1识别CycT1作为底物的一种方式。在体外激酶试验中,CycT1发生PARylation修饰之后,P-TEFb磷酸化Pol Ⅱ CTD的活性下降。与此一致的是,细胞受H2O2处理之后,CycT1发生PARylation修饰,同时由P-TEFb直接调控的HIV-1转录也受到抑制。
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