本论文工作以Tankyrase 1和BRD4两个蛋白质为抗肿瘤活性化合物发现的靶标,在实验室已建立的小分子片段化合物库基础上,利用1D CPMG和STD实验筛选出与靶标蛋白有相互作用的小分子片段化合物,并使用15N标记的靶标蛋白质样品,采集在没有和有阳性片段化合物存在状态下的[1H,15N]HSQC谱图,对靶标蛋白质与阳性化合物之间的结合进行确证并阐明结合位点。同时,X射线晶体衍射技术被用来进一步解析阳性片段化合物和蛋白质所形成的复合物结构,获得的结构信息被用于阐明化合物的构效关系。对于Tankyrase 1,我们使用已经建成的化合物库,通过1D CPMG和STD实验筛选得到了10个阳性片段化合物,在已报道的Tankyrase 1抑制剂中,未见这10个化合物的母核结构的报道。其中化合物1-A4与Tankyrase 1的复合物晶体结构已经被成功解析。对于BRD4,我们通过使用1D CPMG和STD实验以及2D HSQC实验成功发现了与其有特异性相互作用的10个阳性片段化合物,其中8个化合物具有未被报道的新母核结构。抑制活性测试实验显示4个具有新母核结构的阳性化合物有中等强度的BRD4抑制活性,它们对BRD4的半数抑制浓度IC50为100~260?M,这4个化合物具有被继续优化产生先导化合物的潜质。在后续工作中,我们通过2D HSQC化学位移扰动分析实验和复合物晶体结构解析实验进一步阐明了阳性化合物与BRD4之间的相互作用模式,相关数据显示化合物1和化合物2以非乙酰赖氨酸模拟模式与BRD4结合,考虑到非乙酰赖氨酸模拟类抑制剂有成为BRD4选择性抑制剂的可能,我们的发现为后续新型、高选择性BRD4抑制剂的发现提供了一个良好的起始结构。