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纹枯病是水稻世界性的三大病害之一。水稻纹枯病抗性属于典型的数量性状。迄今，在水稻的多个研究群体上已经检测到多个抗纹枯病QTL，涉及水稻的全部12条染色体。其中，利用特青/Lemont已证实水稻第9染色体抗纹枯病QTL qSB-9Tq位于标记Y242-Y92.5之间，并发现一个控制分蘖角的QTL位于其中。利用该组合构建的染色体单片段代换系覆盖目标区间，结合性状鉴定对qSB-9Tq做进一步定位。08年以感病亲本Lemont为受体61份染色体单片段代换系(均不包含分蘖角主效QTL，以排除精细定位qSB-9Tq时分蘖角QTL可能产生的干扰)，根据各个染色体单片段代换系的平均病级和平均病指，进行抗、感聚类，进而对qSB-9Tq的进一步定位。结果发现，qSB-9Tq位于标记RM6971右侧接近端粒的区域，物理区间600Kb左右；09年，增加了精细定位的染色体单片段代换系数量，利用72份代换系群体覆盖分蘖角右侧标记区间，采用同样的试验方法，其结果表明qSB-9Tq位于标记Y92.5-Y93.5之间。
本研究还在Lemont背景的近等基因系水平下，以Lemont作为感病对照，结合性状鉴定，估计了qSB-9Tq的抗性效应。采用同样背景材料以及IR24近等基因系研究了分蘖角对纹枯病的抗性影响。其结果显示：qSB-9Tq提供的抗性约为0.8级；分蘖角QTL qTAC-9Tq抗性效应0.3级左右，对纹枯病抗性存在显著影响。此外，将qSB-9Tq(包含分蘖角QTL的大区间)与两个抗纹枯病QTL qSB-7Tq和qSB-11Lemont进行了效应比较和聚合效应分析。结果发现：qSB-9Tq和qSB-11Lemont互作达到了极显著，qSB-9Tq的抗性显著高于其他两个抗性QTL，预示了qSB-9Tq在抗性育种上有较好应用潜力。