顾宪成是明代杰出的教育家。他创立的东林书院对当时和后世都产生了重大的影响，其教育思想形成了一个完整的体系。 顾宪成针对当时空疏学风的盛行，宣扬经世致用的教育理念，呼吁学者关心时政，倡导日用之学，提出教育要紧密联系实际生活，注重对实际问题的思考与解决。在教育作用和目的论方面，顾宪成主张学术救世，即教育救世。他认为，要扭转世风日下的局面，关键是弘扬道德，而要救道德，则必须从教育入手，从学术入手。顾宪成坚持走“矫之于下”的道路，希望通过书院教育，宣扬传统道德思想，集结有识之士，对社会进行全面改造，根据传统道德的要求重建社会秩序。 在教育内容方面，顾宪成重视道统，强调要尊奉儒家经典，主张理学为主、文艺为辅，反对讲学论道不分主次或标新立异、任意发挥。在道德教育方面，顾宪成反对王阳明“无善无恶”之说，倡导孟子和程朱理学的性善说。在论本体和工夫的关系时，他指出本体是说本性，工夫则指修行，本体为工夫提供了可能，而工夫将本体展现为现实。顾宪成还提出修在悟前、“两忘”和“无我”、实践磨砺、静坐和改过等道德修养方式。 在书院多次被毁废的背景下，顾宪成以破“二惑”为书院教育方式正名，总结归纳了书院教育九个方面的优点。他依《白鹿洞规》，制订《东林会约》，对讲会程序、门籍制度、祭祀制度和日常生活等都予以详细规定，从而完善了书院讲会制度。 顾宪成还在《东林会约》中深入阐述了讲学的基本原理、原则和方法，提出讲学要坚持“四要”，摒弃“九损”，讲习合一，诗歌怡情等。顾宪成要求学者要端正为学态度，坚持自信自立和循序渐进，强调要善问、善听，妥当处理博与约的关系，丰张群学和关键期的自省等。 在选拔人才方面，顾宪成十分强调“君子”、“小人”之分。他深刻认识到人们判别“君子”、“小人”标准的多维性，指出要对“君子”、“小人”分品级，强调对于“君子”、“小人”要破格进退。他还对当时的科举制度腐败成因进行了剖析。顾宪成教育思想突出强调教育的实用性、道统性和受教的自觉性，尽管也有简单的二元化思想和实用的功利性思想，但仍然对明末人才培养、经世致用实学思潮的兴起和书院教育的继往开来等发挥了重要指导和推动作用。以其讲学为源头形成的东林精神更是对后世产生深远影响。顾宪成教育思想对于当今教育，尤其是高等教育的定位、导向、德育和教学方式等都有重要启示意义。