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奶牛乳房炎是一种受多因素影响的易发疾病，也是危害奶牛生产最严重的疾病，从育种角度增强奶牛抗乳房炎能力一直是人们研究的热点。PRKDC基因在先天性免疫的形成上有重要作用，本文以PRKDC基因部分外显子的多态性为研究内容，旨在探索该基因作为奶牛乳房炎抗性标记选择的可行性。 对102头荷斯坦牛的PRKDC基因4个较保守外显子的5对引物的PCR产物进行SSCP分析表明：5对引物中的第2和第3对引物扩增片段具有多态性，第2对引物扩增的片段有3种基因型，分别定义为AA、AB和BB，其基因型频率分别为0.353、0.608、0.038，基因A、B的频率分别为0.657、0.343；引物3扩增的片段有3种基因型，分别定义为CC、CD和DD，其基因型频率分别为0.608、0.333、0.059，基因C、D的频率分别为0.775、0.225。对第3对引物的PCR产物测序发现，等位基因C和D在核苷酸序列的111位点有A／G变异，142位点有T／A变异。 利用最小二乘法分析了PRKDC基因部分外显子位点基因型、场年季、胎次对产奶性状的影响，结果表明：场年季对乳脂率的影响显著(P＜0.05)；除引物3的DD基因型对乳脂率的影响显著(P＜0.05)外，引物2和引物3两个多态位点的其它基因型对乳脂率、305天奶量的影响均不显著(P＞0.05)。本试验所选择的PRKDC基因4个较保守的外显子的不同基因型对SCS的影响不显著(P＞0.05)，说明所研究的4个外显子不是引起乳房炎发病的主要遗传因子。 牛、人、鼠不同属PRKDC基因同一外显子引物1位点序列进行同源性比较表明：人与牛的的同源性为90％，牛与鼠同源性为86％。