随着我国电子商务的蓬勃发展,相关税收问题越来越受到各方关注。2011年7月,武汉国税局对网店“我的百分之一”征税430.79万元,再一次引发电子商务税收热议。电子商务要不要征税,应该怎样征税?这些问题引起了理论界和广大网络交易者的重大关注。一方面,传统商务税收管理中长期存在的征纳税双方信息不对称、纳税不遵从普遍存在、税收征管效率低成本高、税收稽查力量薄弱等老大难问题被电子商务全盘继承,另一方面,随着电子商务小额交易、异地交易及无形产品交易比例的提高,税源监控和税收管辖权的实现也越来越困难,使电子商务对税收征管的挑战日趋严重。因此,研究电子商务背景下的税收征管新特点、新问题、新方法,建立既适应对电子商务管理的需求又能对传统商务遗留问题进行很好解决的税收征管体系,对促进电子商务健康发展乃至维护国家税收权益,都具有重要的理论和现实意义。论文在对电子商务涉税特点、税收征管基础研究和现有电子商务税收方案及对策的大量文献进行归纳、总结的基础上,结合对我国电子商务税收征管现状的分析,运用定性和定量分析相结合的方法,找出了造成现行税收征管体系对电子商务税收征管能力不足的原因；提出了电子商务税收征管体系的总体模型；研究了电子对账、电子发票、电子资金流监控和电子商务税收管辖权分配4项核心功能的实现方案。具体包含以下内容：1)对电子商务涉税特点进行了归纳,总结了电子商务对税收征管带来的5项挑战与1项机遇；澄清了对电子商务涉税观点的认识误区,提出已有文献所指的电子商务税收征管问题不能都归因于电子商务本身,而应将它们分为继承性、放大性和特有性3类,分别研究、区别对待；回顾和评价了传统税收征管中的纳税遵从研究成果和税收管辖权理论；介绍和评价了各方提出的电子商务税收方案及对策。2)从税收征管的流程出发,建立了税收征管力评价指标体系和评价模型。运用定性和定量相结合的方法,对现行税收征管体系的电子商务税收征管能力进行了全面的评价。发现传统税收征管体系对电子商务的税收征管力严重不足,综合税收征管完美度仅为43.93%,及电子商务税收征管的薄弱环节。运用改进鱼骨图对薄弱环节进行分析,发现造成电子商务税收征管力不足的18个原因。通过计算不同原因对税收征管力不足造成的影响,发现继承性问题(如“信息化程度低”)的影响度最高,达50.41%,说明传统商务中的老问题依然是电子商务税收征管的最大威胁；策略性原因(如“缺乏与电子商务平台的合作”)的影响度排名第2,达28.53%,说明近三成的电子商务税收征管力损失可以通过转变观念、澄清思想、改变征管策略挽回；电子商务特性(如“无店铺经营”)的影响度排名第3,达17.68%；放大性问题(如“面向个人销售、异地销售监管难”)的影响度排名最末,仅为3.39%。3)以系统化、科学化、信息化为指导思想,建立了电子商务税收征管体系总体模型。将模型中的系统要素分为功能要素和支撑要素,功能要素又分为按税收征管流程展开的8项环节要素和用于提升环节要素的10项手段要素,对各要素的功能、地位及要素间的相互作用进行了规定。将系统功能的实现层次分为奠基层、科学层、智能层三层,并明确了以位于科学层的电子对账、电子发票、电子资金流监控和电子商务税收管辖权分配为本文要研究的核心功能。4)运用信息化手段,对我国税收征管中最重要的税源监控手段——“以票控税”进行了加强。通过对“以票控税”管理流程的分析,阐明了“以票控税”的原理,提出了对“以票控税”威胁最大的三种不遵从行为分别是不开票、假发票、阴阳票。并就传统手工发票、税控打印发票、电子发票对这三种威胁的抵抗力进行了分析和评价,得出了传统手工发票对这三种威胁基本无抵抗能力、税控打印发票的抵抗力略有提升和电子发票具有较完善的抵抗力的结论。然后,用税收制约链原理对传统税收征管中“以票控税”为何仍能奏效这一问题进行了解释,归纳出税种制约链、凭证制约链和企业内控制约链这三种税收制约链的表现形式。根据税收制约链中的凭证制约链原理,设计了对假发票、阴阳票具有绝大威慑力的电子对账机制。分析了电子对账的原理,提出了如何发现发票信息不符的三条判别原则；对电子对账的实施方案进行了设计,对纳税企业因配合电子对账而产生的遵从成本给予了考虑,并根据不同企业的支出凭证数量和以往纳税表现,分别提供三种方案,以实现买方录入支出凭证。提出了Ⅰ型(嵌入型)、Ⅱ型(非嵌入型)两种电子发票方案及Ⅱ型(非嵌入型)电子发票快速通道服务模式,以分别应用于嵌入和不嵌入税务发票功能的电子商务系统；并对发票的信息防伪机制和查询验真方法进行了设计。5)探讨了利用电子资金流监控加强税源掌握的方法。为弥补“以票控税”无法克制不开票经营的缺点,论文提出从资金流监控税源的思想。构建了由现金监控和账户监控组成的电子资金流监控模型,提出了由银行、电子商务第三方支付服务商、公安、工商、税局等多单位联合建立电子资金流监控网络、高效共享信息以加强税收管理和反腐反黑的思路。将共享信息按信息的私密程度和共享需求分为三个层次,对内部数据、低频跨系统共享数据、高频跨系统共享数据分别规定了储存位置和访问机制。设计了账户交易分类登记、查询制,以实现对涉税资金流的高效监控。设计了法定监控机关内部权限管理机、个人隐私和商业机密保护机制,以实现资金流监控和保护个人隐私、企业商业机密的统一。设计了一种由电子商务交易平台或支付平台对电子商务交易进行自动计税和扣税的机制。首先,对传统商务和电子商务中税源的发现方式进行比较,说明电子商务的纳税人必须依靠电子商务平台来统计。然后,设计了电子商务交易平台和支付平台对电子商务交易进行自动计税和扣税的流程,对交易中使用Ⅰ型(嵌入型)电子发票、Ⅱ型电子发票和Ⅱ型(非嵌入型)电子发票快速通道的情况,分别提供了处理办法。6)论文还对电子商务税收管辖的分配机制和实现原理进行了研究。用“双岛模型”论证了对电子商务税收管辖制度进行变革的必要性：提出了对所得来源地的认定标准和推断方法；提出了对常设机构消失造成税基侵蚀的对策和实现方案；并从“有能力收税”的角度,设计了“管人”、“管物”、“管钱”三种不同税收把柄的使用方式和施行顺序。论文的创新之处在于：1)建立了基于税收征管流程分析的税收征管力评价指标体系和评价模型,发现了当前电子商务税收征管的薄弱环节和薄弱环节成因。2)以系统化、科学化、信息化为指导思想,构建了电子商务税收征管体系总体模型,为完善和发展我国电子商务税收征管体系提出了总体目标和实现方法。3)提出了位于电子商务税收征管体系科学层的电子对账、电子发票、电子资金流监控和电子商务税收管辖权分配4项核心功能的工作原理和解决方案。