我国是农业大国，专职从事农业科技工作的科研机构超过1000家，主要分为国家级农业科研机构、高等院校、省级农业科研机构、地区级农业科研机构四种类型，其中国家级机构、高等院校和省级农业科研机构是我国农业科技创新的主体力量。科研评价工作是科研机构竞争和可持续发展的制度保障。采用定性和定量相结合的科学方法，构建各类农业科研产出的评价指标体系，对于建立与现代农业科研院所发展需求相适应的科研管理制度，具有重大和深远的意义。目前，针对农业科研机构的科研评价研究还十分薄弱，特别是针对农业科研机构科技论文影响力定量评价研究尚未见报道。一般来讲，科研评价主要依据来自科研产出情况。科技论文影响力评价工作是科研评价工作的重要组成部分，本研究从分析科技论文影响力这一要素出发，设计并选取了16个反映科技论文产出总量、质量的论文影响力评价指标，定性遴选了25家国内外主要农业科研机构，分别从SCI/SSCI、ESI和CSI数据库获取机构国际论文和国内论文的统计指标数据，运用文献计量学、数理统计分析等一系列定量评价方法，构建农业科研机构科技论文的影响力评价指标体系，并开展我国主要农业科研机构的评价实践。本论文共五章，主要分为三个部分。第一部分是绪论（第一章）和国内外研究进展综述（第二章），第一张简要阐述了目前我国农业领域科研机构科研产出的现状以及对我国农业科研机构论文产出进行评价的目的和现实意义。并全面介绍了本研究的内容与方法，主要运用文献信息计量学和数理统计的方法来研究国内外农业科研机构的论文产出和影响力，明确我国农业机构在农业科技研究方面的地位，以期为相关管理部门制定政策提供方法和数据支持。第二章系统介绍了目前国内外科研评价的发展历程和论文影响力评价的研究进展，为本论文的实证研究提供了理论依据；第二部分包括数据采集（第三章）和论文影响力评价指标体系的构建及实证分析（第四章）。第三章首先对本研究的目标机构及评价数据来源进行了定性遴选，并依照本研究的目的与数据采集的可操作性，设计了论文影响力评价指标，在此基础上再利用机构检索式，分别对目标机构的国际论文和国内论文数据进行了采集。第四章首先对机构论文按部分单指标作了简单统计分析。然后利用主成分分析法分别构建了国际论文及国内论文的评价指标体系和模型，对国内外农业科研机构论文影响力进行了评价，同时对各机构论文影响力综合得分进行排名。第四部分是全文的总结与讨论（第五章），分析我国农业科研机构论文影响力的研究结果，提出提升我国农业科研机构论文影响力的建议以及研究发现的问题。