目的：通过调查新疆北疆地区25个样本乡镇卫生院的基本情况、基本医疗服务和公共卫生服务的提供情况、以及对村卫生室的管理情况，评价北疆乡镇卫生院的功能落实现状，分析存在的问题及影响乡镇卫生院功能发挥的因素，在此基础上，对乡镇卫生院如何更好地发挥功能提出政策建议。方法：采用定量研究和定性研究相结合的方法进行问卷调查和现场访谈，利用描述性分析分别说明乡镇卫生院三大功能落实情况，通过秩和比法综合评价乡镇卫生院的功能落实现状。结果：⑴基本医疗服务功能：在疾病诊断功能方面，样本乡镇卫生院“三大常规”检查等基本化验检查开展情况良好；在常见病和多发病治疗功能方面，女性流产术、骨伤科治疗、阑尾炎等手术开展率均未超过30%；在转诊服务功能方面，“转出容易转入难”是农村卫生工作中的“常见病”，北疆地区也不例外，转入服务开展率仅为8%。因此，北疆乡镇卫生院的基本医疗服务功能的落实状况不佳。⑵公共卫生服务功能：在健康档案方面，妇女儿童的建档率相对较高，而残疾人和慢性病患者健康档案建立情况较差；在健康教育方面，样本乡镇卫生院通过各种方式全面开展，但并没有从农牧民的健康知识需求出发，健康教育效果有限；在计划免疫方面，接种率全部超过95%，且疫苗接种人员全部持证上岗，说明数量和质量都有提高；在儿童保健和孕产妇保健方面，北疆乡镇卫生院整体落实良好；在慢性病管理方面，因其病情轻、疼痛感弱而被患者和医务人员忽视，管理率不高。总的来讲，北疆乡镇卫生院公共卫生服务功能得到重视，只有少数项目仍需加强落实。⑶管理村卫生室功能：样本乡镇卫生院都履行了辖区内公共卫生管理职能，通过推行乡村卫生服务一体化管理，展开了对村卫生室的业务管理和技术指导。结论：影响乡镇卫生院功能落实的主要因素是人力资源、资金设备和监督管理。因此，首先应加大财政投入力度，保障乡镇卫生院基础建设逐步完善，修建卫生服务之“井”。其次结合新疆实际科学建立一套乡镇卫生院人才培养计划，激活卫生服务之“源”。再次，加强对乡镇卫生院的监管力度，提升其基本医疗服务和公共卫生服务的质量，规范其对村卫生室的管理，保障卫生服务之“流”。最后，政府部门要做好宏观调控，注重乡镇卫生院的自身建设能力和长远发展，使其走上一条长期能够自我发展的道路。