利用荧光定量PCR检测PCV2的方法建立及应用

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猪圆环病毒2型(porcine circovirus2,PCV2)是断奶仔猪多系统衰竭综合征、猪皮炎与肾病综合征、母猪繁殖障碍、仔猪先天性震颤和猪呼吸道综合征等疾病的主要病原,是目前威胁世界养猪业的重要病原之一。本研究建立了检测PCV2DNA的SYBR Green实时荧光定量PCR方法和检测PCV2mRNA的TqaMan荧光定量PCR检测方法,旨在为PCV2感染后病毒载量的动态检测、临床发病猪和亚临床感染猪的鉴别、病毒组织亲嗜性及防治效果评价等方面的研究奠定基础。主要内容及结果如下:1PVC2ORF2基因的克隆根据GenBank中猪圆环病毒2型ORF2基因序列设计一对特异引物,通过PCR扩增得到目的基因片段,之后通过连接、转化、阳性克隆筛选与鉴定、核苷酸序列测定等一系列方法,成功将目的基因克隆到载体上,获得重组质粒。2PVC2SYBR Green荧光定量PCR检测方法的建立通过对GenBank上发表的PCV1和PCV2ORF2的基因序列进行分析,选择PCV2Cap基因的保守区域,设计并合成了一对特异性的引物,通过对荧光定量PCR反应条件的优化,以定量的10倍系列稀释的重组质粒p-18T-Cap为阳性标准品绘制标准曲线建立了PCV2SYBR Green荧光定量PCR检测方法。试验结果表明,该方法检测过程耗时短,特异性强,其敏感性比普通PCR检测方法高1000倍,最低可检测到10拷贝DNA/μL;其标准曲线线性范围是1×102~1×107拷贝,且具有良好的重复性。3PVC2mRNA TqaMan荧光定量PCR检测方法的建立选择PCV2Cap基因的保守区域,设计了一对引物和与之匹配的探针。以重组质粒p-32T-Cap为模板,通过PCR合成DNA片段,反转录复制成mRNA作为阳性标准品。通过优化反应条件和参数,建立了检测PVC2mRNA的TqaMan荧光定量PCR方法。该方法特异性好,敏感性高,最低可检测到10RNA拷贝/μL,标准曲线的线性范围是100~109拷贝/μL,且具有良好的重复性。4应用建立的方法对PCV2体外感染的PK-15细胞及其上清液中DNA和mRNA表达量以及从养猪场采集的不同组织样本中PCV2进行检测,结果表明PK-15细胞内PCV2DNA和mRNA最早于感染后24小时检测到,在感染后48~96小时两者均呈明显呈增长趋势。细胞上清液中PCV2DNA载量的变化规律和PK-15细胞中基本相同;但其mRNA的拷贝数在感染后48~96小时几乎无增长。对临床样本的检测结果显示,PCV2在不同的组织中广泛分布,然而,该病毒在同一组织中的mRNA载量与DNA含量并不一定呈正相关。
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