河湖水域治理活动是一项庞杂的系统工程,河湖水域治理过程中需协调好不同流域以及涉河地区之间的关系。自太湖蓝藻爆发引发用水危机以后,各地区开始摸索推广河长制,让相关政府的党政领导人作为河长,依据法律法规来确定治理机构的责任,统筹安排各个部门,有力的解决了目前水域管理过程中的难题,促进了水资源的改善,提升了水质水平。云南滇池流域2008年开始积极探索河长制,十年的实践云南滇池流域治理已经初具成效。但是,由于河长制提出的时间较晚,因此涉及的审计较少,相关的绩效审计更是寥寥无几。基于此,论文从国家审计角度对河长制背景下河流治理绩效审计进行研究,在现有研究的成果上,建立河流治理绩效评价标准,构建了河流治理绩效审计流程。以“河长制”为突破口,研究了河长制的概况,分析了河长制的出台背景,了解“河长制”的主要任务即水资源管理与保护、河湖水域岸线管理、水污染防治、水环境治理、水生态修复。结合绩效审计理论、生态文明理论、受托责任理论和水资源管理理论,分析河流治理绩效审计要素,构建河流治理绩效评价指标。同时,结合《关于全面推行河长制的意见》等政策法规,对滇池流域的河流治理进行绩效审计,从政策落实执行效益、河流治理资金效益、河流治理效益作为审计切入点,对滇池流域的老宝象河治理进行评价,以期对老宝象河的治理提出有效性建议。本文在河长制背景下提出了河流治理绩效审计,研究了河长制背景下河流治理绩效审计理论,分析了河流治理绩效审计理论要素包括审计主体、审计客体、审计程序和方法、审计目标和审计内容以及审计结果运用,提出了构建相关绩效审计评价指标体系和审计流程,提出了尽早出台河流治理绩效审计评价标准和应用方法,早日实现基于统一标准基础上的大格局审计。