目前,全世界鲸豚类动物至少有92种,须鲸亚目包含4科14种,齿鲸亚目有10科78种。而中国海域记录的鲸豚类至少有37种,占40%以上。包含须鲸类3科4属10种,齿鲸类6科21属27种,按海区分为:渤海7种,黄海18种,东海23种,南海27种。中国海域的所有鲸豚类动物均受到法律保护,其中,中华白海豚(Sousa chinensis)为国家一级保护动物,其他物种均为国家二级保护动物。鲸豚类终生生活在水中,很难有机会碰到,我们对其认识有限,而对它们的研究也更多来自搁浅或误捕的个体。大村鲸(Balaenoptera omurai),为近年发现的须鲸新物种,也是最神秘的须鲸之一。我们对大村鲸的了解甚少,它也被IUCN列为“数据缺乏”物种。大村鲸的外部形态和骨骼特征以及线粒体控制区(Mitochondrial control region,MCR)序列明显不同于现存的须鲸属内其他物种。2011年11月27日,一头须鲸在福建省平潭海域搁浅死亡。该须鲸体长7.15 m。体表皮肤脱落,体色变暗,仅依据外部形态特征初步判定为长须鲸(Balaenopteraphysalus)幼体。扩增获得该个体的两个基因,cox1(Cytochrome oxidase c subunits I gene)和cytb(Cytochrome b gene)的部分序列,在不同数据库中进行相似性检索,多序列比对,分析须鲸属内大村鲸特有位点,并构建了两个基因的系统发育树,最终结果一致认定该个体为大村鲸。同时,对该须鲸个体进行了外部形态测量和描述。大村鲸雄性个体存在乳头则是该物种的首次记录。此外,我们收集到14条确切的有关大村鲸在中国海域的分布搁浅记录。搁浅主要集中在东南沿海海域,尤其是台湾海峡附近海域,推测认为大村鲸可能经台湾海峡及附近海域往返迁徙于日本和所罗门岛海域之间。而中国东南沿海海域很可能是其潜在的重要栖息地之一。大村鲸的单倍型和核苷酸替换数量都非常少,可能是种群数量小,具有较低遗传多样性,更应获得更多的关注和保护。灰鲸(Eschrichtiusrobustus,是灰鲸科内仅有的一种。现仅分布在北太平洋及附近水域,有东、西两个地理种群。西太平洋灰鲸种群的数量相对较少,被列为极危等级。2011年11月5日,福建省平潭县渔民在附近水域误捕一头成年雌性灰鲸。该灰鲸个体长13.09 m,重约21t,是灰鲸在中国海域搁浅/死亡记录中的最大个体;也是21世纪以来中国海域首次灰鲸误捕记录。通过照片比对东、西太平洋灰鲸种群中已识别的个体目录,均未发现与平潭误捕灰鲸相匹配的个体。我们又扩增获得该灰鲸个体cox1,cytb基因和D-loop的序列片段,经序列比对和单倍型分析,期望可以判定该灰鲸个体的种群来源。结果发现该灰鲸的cox1基因序列属于新的单倍型,与东太平洋灰鲸种群可能存在遗传上的差异。而D-loop序列(522 bp)与已报道的单倍型R相同,该单倍型为东太平洋灰鲸种群独有,在西太平洋灰鲸种群中发现的概率极小,依此,推测平潭灰鲸可能是东太平洋灰鲸种群中个体游离闯入台湾海峡,并进一步探讨分析了平潭灰鲸的种群归属问题。搁浅、误捕的鲸豚类动物,由于腐烂或者相似种外形特征较易混淆,仅依据外部形态的物种鉴定也常有失误。我们对收集的部分搁浅、误捕的鲸豚类样品,在形态鉴定的基础上,采用cytb、cox1及D-loop三个mtDNA序列片段重又进行了分子鉴定。通过序列相似性比对及系统发育树的构建分析,成功鉴定了 26份鲸豚类动物样品,并给出了准确的物种名称。样品中有:须鲸2科3种:大村鲸、小须鲸(Balaenopteraacutorostrata)和灰鲸;齿鲸3科10种:小抹香鲸(Kogia breviceps)、印太江豚(Necahocaena ohocaeoides)、小虎鲸(Feresa attenuata)、糙齿海豚(Steno bbredanensis)、印太瓶鼻海豚(Tursiops adduncus)、瓶鼻海豚(Tursiops trunatus)、热带点斑原海豚(Stenella attemuata)、短肢领航鲸(Globicephala macrorhynchus)、中华白海豚(Sousa chinensis和柏氏中喙鲸(Mescoplodon densirostris)。共纠正2种须鲸,8种齿鲸样品的物种名。选以恰当的分子遗传标记,对搁浅、误捕鲸豚类进行的分子鉴定比形态鉴定更准确、便捷、也更有效。在获得37条基因序列中,28条为新的单倍类型:cytb基因9个、cox1基因2个、D-loop17个。我们对鲸豚类的分子鉴定研究,补充了中国大陆沿海海域多个鲸豚类物种的基础资料,也为我们进行物种调查、功能适应性进化等其他科学研究奠定了基础,有助于制定合理有效的物种保护和管理措施。鲸豚类是特殊的水生哺乳动物,大约在53-56 Ma从陆地重新返回海洋。为适应水生生活,外部形态和生理等方面都发生了很多适应性改变,也使它成为研究适应性进化的理想模型。鲸豚类的体型差异是最明显的形态学特征,为探究其分子机制,我们对生长激素(Growth hormone,GH)及生长激素受体(Growth hormone receptor,GHR)基因进行研究,探究两者是否存在相关性。获得13种鲸豚类动物的 gh 基因,同大部分哺乳动物一样,该基因为单拷贝基因,由5个外显子和4个内含子构成,编码216个氨基酸,检测到的9个氨基酸替换,基本都与GHR的结合反应无关。获得11种鲸豚类的ghr基因编码序列,可正常编码639-640个氨基酸,氨基酸替换多出现在膜内结构域,与GH的结合反应相关性也不大。我们基于最大似然法的枝模型、位点模型、枝位点模型等方法对ghr基因进行了适应性进化分析,显示鲸豚类中未检测到正选择作用,也未检测到正选择位点,而是同其他哺乳动物一样,进化速率较慢,经历了纯化选择。gh与ghr基因保守性较强,与鲸豚类体型大小差异未发现具有明显相关性。