植物病虫害是农作物减产的主要原因,给农业生产带来了极大的损失。随着基因工程技术的发展,人们已经能够将多种抗病虫害的基因转入目的植物中。发掘植物自身的抗性基因,培育抗病虫新品种是降低病虫害损失安全有效的途径。在已经发现的抗性基因中发现了很多的保守结构域,理论上我们可以通过提取合适的特征,使用现有的分类器把抗性基因和非抗性基因分离开。本论文没有按照传统方法直接从抗性基因中提取特征,而是利用HMM为抗性基因建模,训练完成后的HMM模型参数在一定程度上可以反应抗性基因与非抗性基因的区别。论文介绍了抗性基因的研究进展,以及蛋白质特征提取的各种方法,最终以预测蛋白质二级结构的15状态HMM为基础,以15状态HMM作为抗性基因和非抗性基因的HMM结构,通过分别对其训练较为成功地对抗性基因与非抗性基因进行了分类,准确率达到90%以上。该15状态HMM并非唯一,更不是最好的用于为抗性基因建模的HMM结构,可以修改该HMM结构并期望能获得更好的结果。随着计算机技术的进步,对于算法、数据的可视化的要求越来越高,算法不仅要能高效地解决实际问题,也要能被大多数人所直观理解,并容易操作。通过在MFC主程序中嵌入第三方应用程序,直观、便捷地完成HMM状态的复制、删除、联接等可视化操作,之后把数据反馈给主程序,最后在主程序中完成核心的HMM算法。