目的：麻疹病毒（MeaslesVirus,MV）是一种重要的人类致病病毒,可引起发热、呼吸道卡他与出疹为主要症状的急性病毒性传染病.该研究的目的是了解东莞市麻疹病毒流行株基因型及系统树分析;研究东莞市麻疹流行特征.结论：2000年东莞市麻疹病毒流行株核酸序列完全相同,为H基因型,说明本次流行的MV具有同源性,来源于同一传染源.2001年麻疹发病率为21.76/10万,以小龄儿童发病为主,外地人口数的多少影响麻疹发病率高低.创新性：对东莞市麻疹流行株采用分子流行病学方法进行检测和调查尚属首次;探索出了获取麻疹病毒核酸标本的简单易行的RT-PCR方法,有利于进行麻疹病毒的基因分型,为快速判断麻疹的传染源和传播途径提供依据,有利于制定麻疹疫情的应急免疫方案.麻疹病毒核酸的变异可引起抗原性的变异,因此,麻疹病毒核酸序列的测定为研制更为有效的麻疹疫苗提供科学依据.掌握麻疹流行特征,为制定科学的麻疹免疫策略提供科学依据.