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本研究对来自在西藏、四川和云南等地的70个小麦条锈菌菌株进行了毒性测定,并利用AFLP分子标记对其进行了遗传多样性研究,获得主要结果如下：1、对70个菌株的小种检测,共检测出23种小种类型,主要为HY-8、CY31、CY32、水-2、水-5、水-13等。其中西藏地区可分为2种类型：水源致病类群及CY28以前的致病类型,水-2和水-5为西藏优势小种。另外,在09年度分离的西藏菌株中,CY28以前类型的小种出现频率高达32.35%,可见西藏地区小种演化速度较云南和四川缓慢。2、从36对EcoRⅠ/MseⅠ引物组合中筛选出E2M2、E3M3、E4M6、E7M6等4对引物组合,共扩增出141条可统计的条带,其中多态性条带为39条,多态率为27.65%。其中引物组合E2M2扩增出的条带最多,多态性也最好。3、通过AFLP分析,参试的70个菌株的遗传相似系数范围为0.55-1.00。当遗传相似系数为0.748时,所有菌株可分为4组。其中来自西藏的菌株大部分被聚类在A组的第一、第二亚组,少数在A组第三、第四亚组和B、D组。A组第四亚组、B组和D组为西藏特有遗传类型。来自四川阿坝州的菌株均属于A组第一亚组,来自四川甘孜和凉山的菌株均属于A组第二亚组。来自云南丽江的菌株分属A组第三亚组和C组。4、毒性分析和AFLP分析均表明,西藏条锈病菌是一个相对独立的群体,具有其独特的毒性和遗传类型,但和邻近地区特别是四川有一定的亲缘关系,存在着菌源交流的可能性。但没有发现特定毒性类型的AFLP指纹特征,相同菌株按毒性和AFLP多态性聚类结果无明显相关性。从AFLP揭示的遗传背景看,西藏菌株多数与四川菌株的亲缘关系较近,少数与云南菌株的亲缘关系较近,而毒性相似系性分析结果表明,西藏和云南条锈病菌种群存在两地间相似而四川种群缺乏的毒性类型,这可能是由于条锈病菌毒性演化可以独立于基因组其他位点的变异。