利用飞行质谱技术研究与结直肠癌相关的蛋白质组构型

来源 :中国人民解放军军事医学科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xingzhe1689
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21世纪,科学家面临着从基因组到蛋白质组的转变,蛋白质组学是后基因时代的一个新兴领域,其理论和技术的发展为肿瘤标志物的研究提供了新的方法。 目前对结直肠癌诊断尚无敏感性和特异性均较高的血清学诊断指标,本研究旨在通过对血清中蛋白质组的质谱分析来发现可用于结直肠癌鉴定的蛋白质组构型。蛋白组学图谱通过SELDI质谱(表面增强激光解析与离子化)产生。用树状模型分析软件对73例结直肠癌患者的血清、31例正常人的血清及16例结直肠相关良性疾病患者的血清进行分析,并反复分析寻找运算规则以确定完全区分癌症和非癌症的蛋白组学模板。用已发现的模板对独立的含120双盲血清样本检测组分组,其中含73例结直肠癌患者的血清、31例正常人的血清及16例结直肠相关良性疾病患者的血清。软件分析结果显示学习组中三类血清蛋白质在质荷比为4 467 Da,8 131 Da,8 939 Da,9 192 Da,9 134 Da,8 221 Da,5 928 Da,8 324Da,11 732 Da 9处含量有显著差异,得到树状分类规则,其分类准确率为98.33%(118/120),敏感性为97.26%(71/73),特异性为100%(47/47);对检测组进行双盲检测,结果显示准确度为96.77%(116/120),敏感性和特异性分别为95.89%(70/73)、97.87%(46/47)。利用SELDI-TOF-MS技术对结直肠癌患者血清、结直肠相关良性疾病患者血清及正常人血清的比较蛋白质组学分析,应用可用敏感性和特异性高的血清蛋白质组模板可对结直肠癌做出快速和准确的诊断。 本研究对LoVo细胞培养液、HT29细胞培养液、LoVo细胞裂解液、HT29细胞裂解液中蛋白质与结直肠癌患者血清中特异蛋白质组构型进行对比研究。发现LoVo细胞培养液共有8处蛋白质含量存在统计学显著性。分子量为2812D、3144D、军事医学科学院硕d二学位论文358lD、4OSOD、5198D、9436D、11731D、14892D。HT29细胞培养液与空白培养液在11处蛋白质含量存在统计学显著性。分子量为28 12D、SO5lD、6098D、6215D、6268D、698OD、7456D、14873D、14945D、15122D、1518OD。LoVo细胞裂解液与空白培养液在6处蛋白质含量存在统计学显著性。分子量为6894D、9521D、9625D、llO74D、13778D、14007D。281OD、1489OD为两种细胞培养液共有的蛋白质。以土研究结果显示,体外培养的大肠癌细胞培养液中蛋白质含量较少,说明环境对细胞的生理状态影响比较大。LoVo细胞与HT29细胞为分型不同的两种大肠癌细胞,两种细胞分泌的蛋白质差别比较大。结直肠癌患者血清中与HT29细胞培养液中无相同分子量的蛋白质,而从LoVo细胞培养液中检测到分子量为1 1 731D的蛋白质与结直肠癌患者血清中特异蛋白质一致,揭示本研究所收集的大肠癌患者与LoVo细胞关系更密切。
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