荧光定量PCR检测仔猪断奶前后水通道蛋白基因mRNA表达差异

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水通道蛋白(Aquaporins, AQPs)是指一类可以选择性高效转运水分子的细胞膜通道蛋白,研究表明水通道蛋白在消化道上皮细胞表达丰富,并参与肠内黏液的分泌。采用仔猪超早期断奶(SEW)技术而导致的仔猪腹泻是早期断奶仔猪最常见的、危害最大的问题。因此明确水通道蛋白在断奶仔猪腹泻的发病机制中的作用,为临床提供治疗的理论依据,提高治疗技术和手段显得尤为重要。本文以猪为研究对象,利用同源序列克隆原理设计引物进行RT-PCR,对猪的AQP2-11基因进行克隆,并进行生物信息学分析。应用实时荧光定量PCR技术,检测ACTB、B2M1、GAPDH、HMBS、HPRT1、RPL4、SDHA、TBP1和YWHAZ 9个看家基因mRNA在仔猪不同组织中的表达水平,确定在仔猪不同组织中用于校正目标基因表达量的最佳基因。然后应用实时荧光定量PCR检测猪的Aqp1、3、7、8、10和11基因mRNA在断奶前后的表达差异。结果如下:1)克隆的猪AQPs家族基因包括Aqp2、Aqp3、Aqp4、Aqp5、Aqp6、Aqp7、Aqp8、Aqp9、Aqp10和Aqp11,所对应的NCBI登录号为EU636238、EU161094、EU165525、EU192130、EU620575、EU024116、EU220426、EU220427、EU582021和EU220425。序列分析结果表明:猪AQPs家族基因各自的选择通透性符合四个亚家族的分类标准。2)看家基因的表达稳定性为HMBS和HPRT1> RPL4> TBP1> B2M1> YWHAZ> SDHA> GAPDH> ACTB,确定了HMBS基因在仔猪不同组织中用于校正目标基因的表达量为最佳选择,而RPL4基因则可以作为高转录本的内参基因。3)仔猪断乳后,猪的AQP1、AQP3、AQP7、AQP10和AQP11在消化道的表达量普遍上升,AQP3和AQP8在胃组织的表达量明显上调。
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