物种之间的系统发育关系及物种形成过程一直以来都是进化生物家研究的焦点。系统发育关系重建可以清楚地显示物种之间的系统发育关系,而物种形成过程的研究能够从本质上解释物种进化的进程。随着测序技术的发展,计算机科学及生物信息学软件的开发给系统发育分析及物种形成过程的研究注入了新的活力。栎属物种存在广泛的种间杂交,引起了植物分类学家们的注意。然而,关于栎属物种的界定和种间系统发育的相关研究非常有限。本文中,依据蒙古栎(Quercus mongolica)和欧洲夏栎(Q.robur)的转录组序列,开发了19对在白栎组(section Quercus)中直系同源的单拷贝核基因序列。使用5个叶绿体位点,探讨叶绿体DNA变异在中国分布的白栎组物种中的共享情况,从而进一步探讨叶绿体序列变异在白栎组物种界定研究中的局限性。最后,利用19个单拷贝核基因序列的数据对在中国和日本分布的白栎组进行了物种界定,以及中国白栎组的系统发育关系研究。主要研究结果如下:1)根据蒙古栎和夏栎的转录组序列开发了19个位点单拷贝基因序列标记,通过所开发的引物扩增栎属白栎组、土耳其栎组和红栎组部分物种的DNA样品,发现这些标记可在栎属中广泛应用;利用这些单拷贝核基因分子标记能很好地界定中国白栎组的两个近缘物种,蒙古栎和辽东栎(Q.liaotungensis),说明单拷贝基因在白栎组物种界定的研究中十分有效。2)基于多种分析方法对于白栎组种群进行分析显示,叶绿体变异没有明确的物种界线,而是与地理位置相符,叶绿体变异在白栎组种群间同域共享,不适合用于物种界定和系统进化的研究。3)使用19个单拷贝核基因位点对白栎组物种进行了物种界定和系统发育研究。Structure分析结果显示K=9为最佳聚类模型,这些单拷贝核基因分子标记能很好地白栎组各物种进行界定。系统发育分析结果表明白栎组的物种主要以南北为界限,分为两枝,得到了100%的支持率。除枹栎出现分化的节点后验概率为0.91外,其余节点的后验概率都不高,推测可能是由于基因渐渗或共享祖先多态造成的。