本文以浓香型白酒窖泥中的原核微生物和真核微生物为研究对象,采用宏基因组学研究方法及最新的454高通量测序技术,结合生物信息学分析技术对北方浓香型白酒发酵微生物物种多样性时空分布模式进行了研究。本文的研究结果如下：1、PCR-SSCP技术对窖泥原核微生物群落的分析。窖泥样品16SPCR-SSCP图谱的条带数为10-18条,Shannon-Wiener多样性指数在2.20-2.88之间。时间分布上窖泥原核微生物群落组成不同,Sorenson相似性指数在0.261-0.700之间；空间分布上窖泥原核微生物群落构成基本相同,Sorenson相似性指数在0.424-0.600之间。对图谱中条带回收和测序,显示样品中含乳酸菌,乳杆菌,梭状芽孢杆菌,戊糖片球菌,酪丁酸梭菌,蜡样芽胞杆菌,以及未培养细菌菌属。2、454高通量测序技术对窖泥原核微生物群落的分析。8个窖泥样本分属于18个门,213个属,细菌总OTU种类为1183个。时间分布上,窖泥细菌群落的演替规律相似,空间分布上,各优势菌群的丰度略有差异。厚壁菌门在整个发酵过程占优势。发酵前期以芽孢杆菌纲、乳杆菌目的菌株占绝对优势。发酵初期拟杆菌门的菌株其丰度值明显高于其它发酵时期。而发酵后期以梭菌纲、胃瘤菌科的菌株占绝对优势,并且在发酵后期属水平上测序出的“Other"占了很大比例。3、PCR-SSCP技术对窖泥真核微生物群落的分析。窖泥样品18SPCR-SSCP图谱条带数为3-6条,Shannon-Wiener多样性指数在1.10-1.79之间。时间分布上窖泥真核微生物的组成略有不同,Sorenson相似性指数在0.22-0.91之间；空间分布上窖泥真核微生物的组成大体相同,Sorenson相似性指数在0.44-0.75之间。对国谱中条带进行回收和测序,显示样品中有酿酒酵母,伏克盾壳霉,克鲁维酵母,鲁式酵母,马拉色菌属,戴尔有孢圆酵母。4、454高通量测序技术对窖泥真核微生物群落的分析。8个窖泥样本分属于5个门,9个纲,10个目,13个科,18个属,真菌总OTU种类为64个。从时间分布来看,真菌的群落组成较为简单,演替规律不明显；从空间分布来看,各窖池优势菌群丰度略有差异。在门纲目科属五个分类水平上分别以Opisthokonta、Nucletmycea、Fungi、 Dikarya、Ascomycota的菌株占绝对优势,丰度值高达94%以上。