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棉花是我国乃至世界上最重要的纤维经济作物。棉属包括4个栽培种和46个野生种,分属于A、B、C、D、E、F、G、K和AD基因组。如此丰富的种质资源为棉花的遗传学研究提供了大量的可试材料,然而,对于明确棉花种间亲缘关系及演化规律的研究,这样数量之多的棉花种类也使研究工作变得更加复杂。此外,棉花染色体普遍存在数量大,形态小,彼此缺乏差异等特点,使染色体的准确快速识别无法实现,这为开展棉花在细胞遗传学领域的研究工作带来了一定的困难。荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybrid