科技是第一生产力,改革开放以来我国就紧跟发达国家的创新步伐,不断地发展与进步,近年来我国政府一直在加大对各大科学研究投入的物力、财力与精力,高校的科研资金逐年增多,然而其科技技术转化率却并不理想,不断上涨的科技资金给他的管理带来了重大挑战,当前各大院校科研经费管理混乱。J大学目前科研经费管理信息平台构建不够完善,科研项目分类管理的方式不利于其后期的管理,预算编制方法较为混乱,流程存在较多的风险点,缺乏有效的考核和监督机制,且2017年初J大学刚成立内部控制部门,关于科研经费内控制度正处于研究讨论的初步阶段。因此对于J大学科研经费内部控制的研究,对J大学而言,有很大的现实意义。作为当地一所典型省属院校,该研究具有一定的区域代表性,对于其他高等院校及科研机构具有现实参考借鉴意义,该研究对于《行政事业单位内部控制》的落地有很大的推进作用,能促进我国科学研究的蓬勃发展。本文基于文献综述法、案例研究法等方法,以内部控制理论、绩效评价理论、预算管理理论作为理论基础,在结合实践实习的基础之上,以典型省属高校J大学为例,从部门层面、业务层面、考核与监督三个层次出发,对其科研经费内部控制现状与存在问题进行描述和分析,为J大学设计了一整套科研经费内部控制改进方案。通过案例剖析,结合J大学科研经费内部控制现状描述与存在问题分析,从三个层面为J大学设计了一整套科研经费内部控制改进方案:一、部门层面,本研究有针对性地为J大学重新构建了财务处科研经费管理组织构架;建议其建立全校材料信息系统、搭建测试化验中心验证平台与实验室共享平台、落实公务卡的应用并构建具有信息共享功能的统一平台;为J大学设计了科研项目分类及代码改进方案并提供细化的预算表编制模板。二、业务层面,本研究从立项与预算、使用和结题结账各个流程图出发,对各环节的关键风险控制点进行风险分析,从而对不同业务流程分别绘制出具体的控制矩阵表,最后结合最新发布的政策文件,对于课题结余经费提出具体的管理措施,供J大学在业务办理时进行参考和借鉴。三、考核与监督层面,本研究为J大学构建科学的科研经费绩效评价机制和激励机制,构建了科研经费全流程监督机制。一系列分析和改进为日后J大学科研经费内部控制建设提供了参考,也可作为其他高校与科研机构科研经费内部控制建设的借鉴依据。