光核桃是我国西藏地区特有的野生桃资源,也是集多种优良性状为一体的珍稀树种。然而,由于地理环境的限制对其所进行的系统研究还较少。本研究以西藏不同地理位置生长的野生光核桃以及郑州和哈尔滨的几种桃种质为研究材料,利用两种分子标记方法(SSR和ISSR)进行以下两方面的研究：①不同地理来源的光核桃资源的遗传多样性特点,②光核桃与其它几种桃资源的遗传关系。从而为光核桃的有效保护和利用提供理论依据。研究结果如下：Ⅰ.SSR的多态性结果：用10对SSR引物扩增72份材料,共扩增出55个位点,多态位点百分率(PPA)较高,为100%；有效等位基因数(Ne)平均值为1.608；Nei’s基因多样性指数(H)平均值为0.342；居群内部基因多样度(Hs)平均值为0.216；遗传分化系数(Gst)为平均值为0.329；居群基因流(Nm)平均值为3.293；Shannon’s指数平均值为0.507,所得数值表明,SSR标记可以反映材料较为丰富的遗传多样性信息。UPGMA聚类分析及主成分分析均显示,46份光核桃材料中,海拔、经度、纬度相近的材料亲缘关系较近,地理位置与亲缘关系具有一定的相关性。72份总材料被分为两大类,第一类主要由西藏野生光核桃组成,第二类主要由河南和黑龙江的种质材料组成,个别野生光核桃与河南来源的材料关系较近。Ⅱ. ISSR分析材料遗传多样性的结果：用筛选出的10条ISSR引物扩增72份材料,共扩增出67个位点,多态性位点百分率平均值为77.12%；等位基因数(Na)平均值为1.7712；有效等位基因数(Ne)平均值为1.3817；Nei’s基因多样性指数(H)平均值为0.2318; Shannon’s指数平均值为0.3565；总基因多样度(Hs)平均值为0.2319；遗传分化系数(Gst)平均值为0.2307；居群基因流(Nm)平均值为1.6678。UPGMA树状聚类分析显示,72份材料分为两大类,第一大类共包括53份材料,其中19份为其它桃,34份为野生光核桃；第二大类包括19份材料,其中7份为其它桃,12份为野生光核桃,分析其地理位置后发现,地理位置与遗传关系没有明显的相关性。主成分分析结果表明部分野生光核桃与河南来源的材料关系较近。SSR、ISSR综合分析结果得出：72份材料的遗传距离与地理位置具有一定的相关性；部分光核桃与郑州来源的种质遗传关系较近；同时对于光核桃种质资源遗传多样性分析SSR分子标记较ISSR分子标记更为稳定。