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财政科技支出是社会资本的补充,对社会科技投入具有引导作用。在过去的17年里,新疆财政科技支出总体保持增长,但占GDP比一直低于全国平均水平,对科技发展支持不足,同时新疆科技成果向现实生产力转化受阻,成果转化率较低。研究新疆政府科技支出对科技产出的影响作用,科学评价新疆财政科技支出绩效水平,对提升新疆财政科技支出管理监督效率、促进科技进步、推动技术经济发展具有重要的理论与现实意义。论文在梳理国内外文献的基础上,界定财政科技支出相关概念,奠定研究的理论基础、选取DEA-VRS超效率模型、Malmquist指数作为绩效评价方法。在阐述新疆科技进步与财政科技支出现状时,主要运用统计描述方法展开分析,发现2000-2016年间的17年里,新疆科技进步水平低,科技进步环境恶化、科技成果转化率低;新疆财政科技支出、R&D人员投入规模持续增加,但是支持强度均低于全国平均水平;新疆科技产出方面,科技成果转化率低是突出问题。进而,借鉴前人研究观点来构建新疆财政科技支出绩效评价指标体系,分别运用DEA超效率模型、Malmquist指数进行静态、动态绩效分析。DEA超效率模型分析结果表明,2005-2016年新疆财政科技支出绩效水平低,原因在于技术与管理水平低,通过增加财政科技支出可以增加科技产出水平;Malmquist指数分析结果表明,2005-2016年,新疆技术效率下降、政府财政科技预算管理效率低,导致财政科技支出绩效下降。最后,分析影响新疆财政科技支出绩效水平低的主要原因,从五方面提出相应对策,建议充分发挥政府科技扶持职能,健全科技成果转化支持体系,强化企业技术创新的主体作用,完善财政科技支出机制,积极培育科技人才。