中国不同地区马铃薯疮痂病菌遗传多样性分析

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马铃薯疮痂病由多种病原链霉菌(Streptomyces spp.)引起。虽然链霉菌种繁多,在土壤中也很丰富,但也只有少数种类才能致病。植物病原链霉菌已经通过DNA序列相关性,16s rDNA序列和表型特性等手段确定具体种。被世界各地广泛报道的即Streptomyces scabies。马铃薯疮痂病的发生严重程度依不同地区,同地区不同年份,作物品种的不同而不同。这些差异是由于不同的环境和马铃薯的品种的基因多样性引起的。而对于病原的基因多样性却几乎没有相关报道。为了测定中国不同地区马铃薯疮痂病菌的遗传多样性,本研究对中国8个省(区)采集分离得到的马铃薯疮痂病菌30株进行16S rDNA序列分析和表型特征分析。所测试菌株中23株可以与Streptomyces scabies(10株)、Streptomyces bobili(5株)、Streptomyces enissocaesilis(3株)、Streptomyces diastatochromogenes(2株)、Streptomyces turgidiscabies(1株)、Streptomyces galilaeus(1株)、Streptomyces setonii(1株)等7个模式菌株归为一类。表明我国马铃薯疮痂病菌存在明显的多样性。其余7个菌株在表型特征上比较近似于Streptomyces bobili模式菌株,但依据16S rDNA序列分析将它们归为Streptomyces galilaeus一类。本项研究中与S.bobili、S.galilaeus、S.enissocaesilis、S.diastatochromogenes链霉菌种相似的菌株是首次报道为疮痂病病原。对菌株种类进行分析发现,与Streptomyces scabies相似的菌株来源于黑龙江、内蒙古自治区、四川、山东、甘肃等省;与Streptomyces galilaeus相似的菌株来源于内蒙古自治区;与Streptomyces bobili相似的菌株来源于河北、内蒙古自治区、山西等省;与Streptomyces diastatochromogenes相似的菌株来源于山东、陕西省;与Streptomyces enissocaesilis相似的菌株均来自于陕西省;1株Streptomycesturgidiscabies菌来自陕西;此外,还有来自山东的Streptomyces setonii菌1株。本研究表明我国马铃薯疮痂病菌存在明显的多样性。同时,本文为研究中国马铃薯疮痂病菌原链霉菌群体多样性奠定了基础。
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