抗结核药物性肝损伤中环状RNA表达差异研究

来源 :华北理工大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:whansiyu
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目的研究抗结核药物性肝损伤(anti-tuberculosis drug-induced liver injury,ADLI)中环状RNA(circular RNA,circRNA)的表达差异,寻找与ADLI有关的circRNA。方法主要从细胞和人群两方面进行研究。细胞研究中,将不同浓度的两药联合(异烟肼+利福平)、三药联合(异烟肼+利福平+吡嗪酰胺)药物作用于HL-7702人正常肝细胞系,CCK8法检测加药48h后细胞存活率,筛选出最佳浓度(存活率70%-80%)。以最佳浓度建立肝细胞损伤模型,分为两药联合组、三药联合组和正常对照组,各组分别在加药3、6、12、24、36、48h后收集细胞和细胞培养上清液。ALT、AST的检测利用赖氏法进行;常规Trizol法提取肝细胞的总RNA;芯片技术筛选差异表达circRNA;miRanda-3.3软件预测circRNA的靶miRNA;RTqPCR法验证差异表达circRNA。单因素方差分析或t检验判断ALT、AST和circRNA在组间是否有差异,Pearson相关分析判断circRNA与ALT、AST之间是否相关。人群研究中,收集2015年7月2016年7月在唐山结核病院被确诊为肺结核的住院患者的临床资料和血标本。将符合条件的病例分别纳入肝损伤组和非肝损伤组,用于差异表达circRNA的筛选(每组16例)和验证(每组98例),非肝损伤组以抗结核药物化疗方案、性别、年龄为匹配因素,与肝损伤组进行1:1匹配。circRNA的筛选、验证和靶miRNA预测方法同HL-7702肝细胞实验。利用配对t检验或配对χ2检验判断人群资料、circRNA、ALT和AST是否具有组间差异;利用Pearson相关分析判断circRNA与ALT、AST之间是否相关。结果两药联合诱导肝细胞损伤模型组中差异表达的circRNA共40965个,其中表达上调的circRNA共14863个,表达下调的circRNA 26102个。三药联合诱导肝细胞损伤模型组中差异表达的circRNA共10248个,其中表达上调的circRNA共2320个,表达下调的circRNA共7928个。ADLI患者血浆中差异表达的circRNA共6661个,其中表达上调的circRNA共273个,表达下调的circRNA共6388个。在两药和三药联合肝细胞损伤模型以及ADLI患者血浆中均差异表达的circRNA共112个;其中在两药组和ADLI患者血浆中均上调倍数最大的是hsacirc0010996,在三药组中上调倍数最大的是hsacirc0033188;分别在两药组、三药组和ADLI患者血浆中下调倍数最大hsacirc0012054、hsacirc0025088和hsacirc0021214。差异表达circRNA靶mi RNA预测结果显示,除hsacirc0021214外只预测到92个靶miRNA外其余4个circRNA均预测到100个靶miRNA。差异表达circRNA验证结果显示,hsacirc0010996在两药组、三药组和ADLI患者血浆中均表达上调,与芯片筛选结果一致。结论在两药联合和三药联合诱导的肝细胞损伤模型中分别筛选到40965个和10248个circRNA,患者血浆中筛选到6661个circRNA。细胞中与血浆中差异表达一致的circRNA有112个。得到验证的circRNA是hsacirc0010996,与肝功指标ALT和AST具有相关性,说明其与ADLI密切相关。
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