本论文包括以下两个部分一、渐渗杂交是自然界中比较常见的现象,不过在爬行动物中相对较少。本文对渐渗杂交研究、线粒体基因以及线粒体基因COⅠ进行了综述。二、密点麻蜥与荒漠麻蜥有着同域分布区。之前的研究表明密点麻蜥和荒漠麻蜥亲缘关系很近,且遗传距离明显低于麻蜥种间差异水平,亚种水平又远远不足。然而,在形态学上,密点麻蜥又与荒漠麻蜥截然不同。它们不仅繁殖方式不同,而且形态差异很大,出现这种情况可能是由于渐渗杂交。为了探究这一现象,本文利用线粒体基因COⅠ作为分子标记,对序列分析说明在二者分布区的重叠区边缘,这两种麻蜥的mt DNA基因相互渗透。本文中通过对序列的拼接比对,最终用于遗传分析的有采集于12个样点的密点麻蜥34个、荒漠麻蜥14个以及3个从形态学上初步鉴定为杂交个体,共51个个体,获得密点麻蜥单倍型25个,荒漠麻蜥单倍型4个,杂交个体单倍型一个。并且发现三个荒漠麻蜥的COⅠ线粒体基因具有密点麻蜥的基因模式,证实密点麻蜥与荒漠麻蜥存在渐渗杂交。其中一个杂交个体及其共享单倍型具有荒漠麻蜥的基因型,并且其与荒漠麻蜥最小遗传距离为0.5%。从系统进化树来看,其与荒漠麻蜥聚成一支,但却有两者的形态和密点麻蜥的繁殖方式,这也是密点麻蜥与荒漠麻蜥存在渐渗杂交的证据。通过对遗传距离的分析发现二者分布区的重叠区边缘的荒漠麻蜥与密点麻蜥的遗传距离非常小只有0.2%,这个值远远小于密点麻蜥种内水平。对构建的三种进化树分析发现,阿左旗荒漠麻蜥与中卫阿左交界密点麻蜥聚成一支,说明其亲缘关系非常近,同样,也说明了二者存在渐渗杂交。本文还通过对密点麻蜥118个个体、荒漠麻蜥35个个体的表型进行表述和总结,对可数可量形状进行了统计。对可量性状做单因素方差分析及主成分分析,得出密点麻蜥与荒漠麻蜥具有显著差异(P<0.01)。由于mt DNA在遗传的过程中可能带有不完全母系遗传,所以无法判断基因的流动方向。本文用线粒体基因标记的方法证实了密点麻蜥和荒漠麻蜥存在渐渗杂交,对今后的渐渗杂交提供了依据,也为物种进化的研究给予参考。