本文对明清之际藏传佛教格鲁派与蒙古政权的互动关系进行了分析。宗教与政治作为人类两大文化现象，二者间有着密切的关系。宗教的传播与发展对政治有着很强的依附性。某一宗教或教派获得统治政权的支持，是这一宗教或教派得以顺利传播、发展的有利条件；反之亦然。宗教作为上层建筑的组成部分之一，可以对政权统治发挥辅助作用，有利于维护社会的稳定与和平。封建国家政权利用宗教观念来为自己的统治服务，利用人们对宗教的信仰来维护、加强自己的统治地位。明清之际是我国历史上形势急剧变化的时期。藏传佛教格鲁派为了获得强大的世俗政权势力的支持来摆脱困境，它跨越民族界限，积极向蒙古地区传教。藏传佛教以格鲁派的形式二次传入蒙古地区，蒙古族统治阶级出于巩固政权、维护统治的需要，进而大力支持藏传佛教格鲁派。藏传佛教中的“轮回转世观念”、“因果报应学说”、“戒杀放生”、“慈悲、忍辱”等教理教义，对维护蒙古统治阶级的利益、巩固其统治地位，安抚民众、稳定社会等都能起到重要作用。因此，蒙古封建主对格鲁派在蒙古地区的传播、发展，从政治、经济、宗教事业等各方面都给予了极大的支持，经过短短的几十年，便取替了原有萨满教的地位，成为蒙古民族的共同信仰。 蒙古土默特部首领俺答汗，出于自身政治上的需求，将藏传佛教格鲁派引入蒙古地区，从而揭开了蒙藏民族关系、蒙藏政教关系新高潮的序幕。蒙古各部领主利用藏传佛教克服政权正统观念，树立自己的威望，巩固统治地位，使格鲁派为他们的现世统治服务。在蒙古地区，强大的世俗政权势力也客观上影响着宗教内部的发展态势，蒙古各部活佛、大喇嘛的产生，都与世俗政权的参与，有着密切的关系，他们多出自于封建统治阶级家族。而这些活佛、大喇嘛掌握宗教领导权后，又可以进一步维护、巩固其世俗家族的政权统治；他们也可以参与世俗政治，对各部落间矛盾纷争的化解起到了积极的作用。藏传佛教格鲁派与蒙古政权间的互动，使人们虔诚地信仰着格鲁派，这一局面对整个蒙古社会的稳定、战乱后经济的恢复与发展、各部间纷争的化解等都发挥出了宗教信仰所产生的积极作用。然而，蒙古民族对藏传佛教格鲁派虔诚信仰所产生的消极影响，也是不可忽视的。随着时间的推移，它对整个蒙古民族的向前发展产生了一定的阻力。社会政权各自为政、缺乏统一领导，不适生产人数剧增，人口总数锐减，经济发展缓慢，劳动人民负担沉重不堪等。