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目的探讨Her-2、p63、BRCA1在胃癌发生、发展中的作用，并为胃癌的分子靶向治疗提供探索实验及临床治疗依据。方法采用组织芯片法和免疫组化PV-9000二步法检测人胃癌组织和癌旁组织中Her-2、p63、BRCA1蛋白表达，分析它们与胃癌临床病理因素关系。结果胃癌组织中Her-2蛋白阳性表达19例（16.24％），癌旁组织无阳性表达，二者表达差别有统计学意义（P<0.01）；p63蛋白和BRCA1在胃癌组织的阳性表达分别为42例（35.90％）和23例（19.66％），癌旁组织中阳性表达分别为4例（5.06％）和2例（2.53％），差异均有统计学意义（P<0.01）。Her-2在无淋巴结转移组中Her-2阳性表达率为7.69%（4/52），有淋巴结转移组中阳性表达率为23.08%（15/65），两组表达差异有统计学意义（P<0.05）；Her-2在TNM分期中I-II期胃癌组织中的阳性表达率为7.55%（4/53），III-IV期中的阳性表达率为23.44%（15/64），两组表达差异有统计学意义（P<0.05）；Her-2蛋白阳性表达与胃癌患者性别、年龄、肿瘤大小、部位、组织学分级及浸润深度均无显著相关性（P>0.05）。p63在高分化的胃癌中的阳性表达率为17.64%（3/17），在中分化胃癌中的表达为26.19%（11/42），在低分化胃癌中的表达为48.28%（28/58），p63在三组表达差异有统计学意义（P<0.05）；p63蛋白在无淋巴结转移组中阳性表达率为21.15%（11/52），有淋巴结转移组中阳性表达率为47.69%（31/65），两组表达差异有统计学意义（P<0.01）；p63蛋白在TNM分期中I-II期胃癌组织中阳性表达率为7.55%（4/53），III-IV期中的阳性表达率为59.38%（38/64），两组表达差异有统计学意义（P<0.01）；p63蛋白阳性表达与胃癌患者性别、年龄、肿瘤大小、部位、浸润深度均无显著相关性（P>0.05）。BRCA1在TNM分期中I-II期胃癌组织中BRCA1阳性表达率为35.85%（19/53），III-IV期中的阳性表达率为6.25%（4/64），两组表达差异有统计学意义（P<0.01）；BRCA1蛋白阳性表达与胃癌患者性别、年龄、肿瘤大小、部位、组织学分级、浸润深度、淋巴结转移均无显著相关性（P>0.05）。经Spearman秩相关分析，胃癌中Her-2的阳性表达与p63的阳性表达呈正相关（P<0.01，r=0.299）；Her-2的阳性表达与BRCA1的阳性表达呈正相关（P<0.01，r=0.307）；BRCA1的阳性表达与p63的阳性表达呈正相关（P<0.01，r=0.302）。结论Her-2、p63、BRCA1在胃癌的发生发展中可能起着重要的作用，对三者表达的联合检测有助于胃癌的预后判断。