汉族人群激素性股骨头坏死SNP及部分敏感基因甲基化情况的分析研究

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激素性股骨头坏死(SONFH),是使用类固醇激素后出现的非创伤性股骨头坏死(NONFH),又称股骨头缺血性坏死,与高甘油三酯、胆固醇、骨坏死家族史、凝血病等多种高危因素相关。使用激素后,机体可出现破骨细胞生成增多、骨细胞生成减少、肌肉萎缩、钙吸收减少等改变,随后发生微循环减少、骨质疏松,最终进展为病理性骨折。糖皮质激素是治疗神经免疫性疾病的主要药物之一,在所有出现SONFH的原发疾病中神经免疫性疾病至少占2.31%,给社会及家庭带来沉重的负担,及早防治意义重大。中医将SONFH归为“骨痹”,病位在骨、关节,本为气血不足、肝肾亏虚,涉及脾、肾、肝等多个脏腑,标为风、寒、湿、热、痰、瘀。并认为其是先天遗传与后天药物等交互作用的结果,发病有着特异的体质基础。肾为先天之本,对应着基因遗传多态性,对表观遗传、转录、翻译等起决定作用。脾胃为后天之本,对应着饮食、气候等外界环境可通过表观遗传修饰及基因突变作用机体并遗传给下一代。这也合于“先天促后天,后天养先天”的说法。现代医学倾向SONFH是一个多基因遗传病,涉及激素受体、代谢转运、氧化应激、遗传、神经突触、脂质及骨代谢等多种机制,药物等的表观遗传修饰可与遗传基因多态性产生交互作用,基于对该病的遗传结构特征的研究我们可以准确把握疾病的发展规律。综述国内外文献发现,NR3C1、ABCB1、NOS3、MTHFR、CYP3A4、SYN2、IGFBP3、PON1、APOA5等9个基因的遗传多态性与汉族人群的SONFH发病密切相关。本实验收集了汉族人群可用血液标本193例(SONFH病例组79例、使用激素未出现骨坏死的验证干预组114例),对其上述9个基因上的18个SNP位点进行检测,并对阳性位点的DNA甲基化水平测定。目的:通过对SONFH相关基因及其DNA甲基化水平交互作用的遗传结构研究,探讨该病的发病机理,以期将来建立SONFH的基因网络模型,为疾病的中西医结合诊疗提供全息图景。方法:1.采用i MLDR法对病例组中79例SONFH、验证干预组中114例使用激素未出现骨坏死患者的18个SNP位点(rs100529579、rs1045642、rs1128503、rs1799983、rs1801133、rs2032582C、rs2032582T、rs227980、rs2279750、rs2453839、rs308952、rs3110697、rs3755724、rs3817004、rs41423247、rs662、rs662799、rs99365)进行检测,并纳入汉族人群基因组数据库中208例正常人的基因数据作为正常对照组进行统计分析。2.采用Methyl Target技术对符合要求的59例SONFH、85例使用激素未出现股骨头坏死患者的IGFBP3、ABCB1、NR3C1、MTHFR基因扩增子上11个Cp G岛上的甲基化水平进行检测,分别就位点、片段、基因上的甲基化水平进行统计分析,最后利用e QTLD技术对SNP与位点甲基化水平的交互作用进行统计分析。结果:1、一般资料:病例组79例(女45,男34),年龄50.65±13.95岁,验证干预组114例(女65,男49),平均年龄42.63±19.27岁。病例组与验证组相比,年龄存在统计学差异(t=3.3305,P=0.001),性别无统计学差异(t=0.1273,P=0.8989)。2、所有样本哈迪-温伯格平衡(HWE)质控:所有样本18个SNP位点HWE检验均P>0.05,符合平衡。3、所有样本SNP分析情况:病例组等位基因频率与验证干预组比较发现rs2242480等位基因T患病风险低,与正常人群比较,rs1801133等位基因G患病风险高;病例组基因型频率的验证干预组比较,rs3110697基因型A/G患病风险低,与正常组比较,rs1801133基因型G/A患病风险高、rs3110697基因型A/G的患病风险低;与验证干预组比较,在显性模型下rs2032582T等位基因T的患病风险低,在隐性模型下rs3110697等位基因A的患病风险低。与正常组比较,在显性遗传模型下,rs10052957等位基因A和rs1801133等位基因G的患病风险高;在隐性遗传模型下,rs3110697等位基因A的患病风险低。与验证组相比ABCB-1(rs2032582T与rs1128503)、SYN2(rs3755724、rs2279750、rs3817004)存在较强连锁程度,与正常组比较ABCB-1(rs1045642、rs2032582T)、SYN2(rs3755724与其余SYN2基因位点)存在较强连锁程度,病例组与验证组及正常组相比分别有34组、16组SNP间存在交互作用。4、病例组与验证干预组甲基化水平及其与SNP交互作用分析:ABCB1_1POS.192,ABCB1_2 POS.43,IGFBP3_2 POS.143,MTHFR_2 POS.42位点甲基化水平高患病风险高,MTHFR_1 POS.36,MTHFR_1 POS.77,MTHFR_1 POS.139,NR3C1_2 POS.163,NR3C1_4 POS.47位点甲基化水平高患病风险低。ABCB1_2片段的甲基化水平P=0.024,存在统计学差异。ABCB1基因的甲基化水平P=0.04,存在统计学差异。ABCB1_2 ctttttttttttttttttttttttt、IGFBP3_1 tttttttttcttt、IGFBP3_3tttttttctttttttt、IGFBP3_2 ttttttttttttctttt、IGFBP3_2 ctttttttttttttttt、NR3C1_4ttttctttttttt、NR3C1_1 tttttttttttttctt、MTHFR_1 ttttttcttttttttttttttttttt、NR3C1_4ttttttttttttt、MTHFR_1 tttttttttttttctttttttttttt、ABCB1_2 tcttttttttttttttttttttttt、ABCB1_1ttctttttttttt、MTHFR_1 tctttttttttttttttttttttttt、MTHFR_1 ttttttttttttttttcttttttttt、NR3C1_1cttttttttttttttt单倍型检测有统计学差异。22对SNP、位点甲基化水平的近距离(顺式)作用、139对的SNP、位点甲基化水平的远距离(反式)作用存在统计学差异。结论:激素性股骨头坏死是一种多基因病,SNP与DNA甲基化水平的广泛交互作用或主导疾病进程,其发生发展有一定的复杂性及必然性,与中医的先天、后天的理论相互契合。可纳入各种因素并借鉴中医辨证体系以期将来建立SONFH的基因调控网络模型,将为精准医疗理念下的疾病诊治提供全息图景。
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