小豆起源于中国,是我国传统的、特色食用豆类作物,但随着我国小豆市场不断扩大,且优质品种退化严重,因此选育高产优质的小豆品种是小豆育种的主要任务之一。本研究以269份来自全国范围内的小豆种质资源为研究对象,在2016及2017年间对小豆资源农艺性状进行调查统计,利用SSR分子标记技术对试验材料进行遗传多样性分析评价,并对小豆主要农艺性状与SSR标记进行关联分析,主要结果如下:1.对269份来自全国不同地区的小豆材料进行形态学多样性分析,结果显示,参试材料的16个农艺性状具有丰富的变异类型,各个性状之间具有明显的相关性,且环境条件对小豆生长影响较大。主成分分析确认4类影响因子,说明对小豆生长影响较大的是生育日数、株高、单株英数和单英粒数,这四个农艺性状也可以作为小豆选种的指标。利用Powermarker根据2016年的农艺性状进行聚类分析,发现所有的参试材料大致可以分为六类,而2017年聚类分析将参试材料分为五大类,各类群间性状差异明显,但聚类结果两年不同,因受环境影响较大,群体的性状表现跟地理来源之间没有直接的关系。2.利用已发表的117份小豆SSR引物对12份小豆进行引物筛选,得到40对多态性良好且扩增稳定的小豆引物。利用40对SSR标记对所有的小豆材料进行多样性分析,共检测到192个等位基因(NA),平均为4.8个,变异范围为3-8个,平均有效等位基因数(NE)为3.275个。Nei’s基因多样性变化范围为0.541(X168)—0.804((AG)26),平均值为0.423。多态性信息含量PIC值的变异范围为0.459—0.779,平均为0.623。在16个小豆群体整体水平上,有效等位基因数(NE)为2.963,基因多样性指数为0.494,PIC值为0.434。不同地理来源组群的NE介于1—4.25,辽宁最高,贵州最低;遗传多样性指数介于0-0.647,辽宁最高,贵州最低,PIC值介于0-0.590,辽宁最高,贵州最低。聚类分析将269份材料分为两大类群,且划分结果与地理来源有一定的关系。而16个小豆地理来源群可以分为三个类群,与地理来源有关。3.利用Structure软件对参试小豆进行群体分析,结果得到269份小豆材料从遗传结构上被分为两大类,其中东北三省及河北省、北京市这一区域的材料被聚在一起。研究通过Q值纠正假阳性关联后,利用tassel软件将SSR标记位点与小豆性状进行关联分析,发现2016年共有6个位点与性状相关联,2017年共有9个位点与性状相关联,且X25与2016年的英宽和2017年的生育日数均相关。