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目的：探讨心脏发育相关基因胰岛因子1(Isletl, ISL1) SNP位点(rs41268421、 rs1017)与先天性心脏病(Congenital Heart Disease, CHD)的相关性,为阐明CHD的发生机制并进行遗传学干预提供理论依据,为其他先天畸形的研究提供科学的方法。方法：1利用NCBI网站SNPs数据库查找ISL1基因内部和周围所有SNPs,同时参考相关文献,确定所要研究的SNPs位点。2采用病例-对照研究方法,选取2011年12月至2012年12月在天津市儿童医院心内科住院接受治疗的35名CHD患儿纳入本研究,其中男孩18例,女孩17例,男女之比为1.06：1,年龄7月至3岁,平均年龄23±6月。患儿均符合CHD的诊断标准,具有典型的临床症状,并经心脏彩色超声、心导管或手术证实,其中室间隔缺损类型患儿18例,房间隔缺损类型患儿17例。来自我院同期外科收治的除外CHD的30名儿童作为对照组,其中男孩15例,女孩15例,男女之比为1：1,年龄6月至3岁,平均年龄22±9月,经心脏彩色超声明确未患有CHD。采集所有研究对象的外周静脉血2ml,枸橼酸钠抗凝,于-80℃保存备用。3基因测序并评价SNP位点和CHD的相关性。从血液中提取DNA,应用聚合酶链反应(PCR)联合直接基因测序技术对研究对象的ISL1基因SNPrs41268421、rs1017多态性进行检测。分别比较两个SNP位点基因型频率和等位基因频率在两组的分布情况,并进行单体型分析。结果：1ISLl基因SNP位点rs41268421存在GG、GT、TT3种基因型,CHD组携带T等位基因的基因型(包括GT和TT)频率与对照组相比具有明显的差异,差异显著(χ2=4.169,P<0.05),并且CHD组携带T等位基因的基因型频率高于对照组。携带T等位基因的儿童患CHD的危险是G等位基因的4.833倍。2ISL1基因SNP位点rsl017存在AA、AT、TT3种基因型,CHD组携带T等位基因的基因型(包括AT和TT)频率与对照组相比具有明显的差异,差异显著(χ2=6.807,P<0.01),并且CHD组携带T等位基因的基因型频率高于对照组。携带T等位基因的儿童患CHD的危险是A等位基因的4.491倍。3对ISL1基因SNPrs41268421、rs1017这两个位点单体型进行分析,共检出4种单体型,分别是GA、GT、TA、TT,其中表现TT单体型的儿童患CHD的危险度最高(OR=7.813)。结论：1ISL1基因SNP rs41268421、rs1017位点多态性可能与中国汉族儿童CHD易感性相关。2ISL1基因SNPrs41268421位点等位基因T可能为中国汉族儿童患CHD的危险因素。3ISL1基因SNPrs1017位点等位基因T可能增加中国汉族患儿童患CHD的危险性。4对ISL1基因SNPrs41268421、rs1017两位点进行单体型分析,得出在这两个位点表现TT型的儿童具有较高的患先天性心脏病的风险。