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目的:分析福建地区非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)血清蛋白表达谱的改变,筛选并建立NSCLC血清蛋白的差异表达谱;测定福建地区NSCLC患者表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突变;寻找EGFR基因突变的NSCLC患者与EGFR基因野生型患者外周血差异性蛋白。方法:应用表面加强激光解析电离化飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术,以弱阳离子芯片结合血清蛋白质,分析34例NSCLC患者和34例正常对照血清,获得蛋白表达图谱。用Biomarker Pattern软件分析NSCLC差异蛋白并初步建立诊断模型。通过盲筛进一步验证诊断模型。提取20例NSCLC患者新鲜癌组织及其对应的正常组织标本的DNA,对其行EGFR基因巢式聚合酶链反应(nested polymerase chain reaction,nested PCR)及脱氧核糖核酸(Deoxyribonucleic acid,DNA)测序技术分析NSCLC患者EGFR基因突变情况;应用SELDI-TOF-MS技术寻找EGFR基因突变的NSCLC患者与EGFR基因野生型患者外周血差异性蛋白。结果:应用弱阳离子芯片,发现NSCLC患者血清与正常人有11个显著差异的蛋白波峰。其中显著高表达蛋白质波峰5个,质荷比分别是2959.77 Da,3209.05 Da,3286.37 Da,8000.69 Da,15982.85 Da (P<0.05),单独波峰诊断NSCLC的灵敏度分别为91.18%、91.18%、85.29%、73.53%、76.47%;特异度分别为82.35%、85.29%、75.53%、67.65%、61.76%。显著低表达蛋白质波峰6个,质荷比分别是6221.60 Da,6459.09 Da,6651.87 Da,8590.69 Da,8719.24 Da,13804.88Da (P<0.05),其单独波峰诊断NSCLC的灵敏度分别为88.24%、91.18%、79.41%、76.47%、85.29%、76.47%;特异度分别为79.41%、88.24%、85.29%、76.47%、79.41%、91.18%。经Biomarker Pattern(BPS)软件分析,建立分类树模型,其诊断的灵敏度为100%,特异度为94.12%。盲筛验证结果显示,其准确率为92.65%,灵敏度为94.74%,特异度为90.00%。比较了不同病理类型之间、不同病理分期之间以及吸烟与非吸烟的NSCLC患者之间的外周血蛋白质谱,未发现有显著性差异的蛋白峰。对15例NSCLC根治术患者,手术前及手术后7天时的外周血标本进行蛋白质谱分析。发现手术后有显著升高的蛋白质峰2个,质荷比分别是6137.16Da,9320.54 Da(P<0.05)。30例NSCLC患者化疗前后外周血蛋白质谱分析,未发现有显著性差异的蛋白峰。20例NSCLC患者的正常组织EGFR第19,21外显子均为野生型,而20例NSCLC患者的癌组织EGFR基因突变检出率为15%(3/20)。第19外显子缺失突变1例,第21外显子替代突变2例。对EGFR基因突变组与EGFR基因野生型组患者手术前的外周血进行蛋白质谱分析,未发现两组之间有显著性差异的蛋白峰。结论: SELDI-TOF-MS技术可筛选出NSCLC差异性蛋白并建立NSCLC诊断的分类树模型,有望成为NSCLC早期诊断的辅助指标。未发现不同病理类型之间、不同病理分期之间以及吸烟与非吸烟的NSCLC患者之间外周血存在显著性差异的蛋白峰。NSCLC患者手术前后外周血清蛋白质组学水平存在差异。未发现化疗前后外周血存在显著性差异的蛋白峰。尚未发现EGFR基因突变组与EGFR基因野生型组患者外周血之间有显著性差异的蛋白峰。