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西南地区在我国的经济发展和生态环境建设中占重要地位，但也是我国生态环境最脆弱的地区之一，生态系统退化，生态功能减弱，严重制约着西南林业的可持续经营与发展。本项目采用DNA分子标记SSR研究不同生境条件下粗枝云杉群体的遗传变异及其时空分布格局，考察遗传变异与复杂的山地生态环境间的潜在联系，系统地揭示粗枝云杉天然群体与环境系统相互作用的生态适应与分子进化机制。粗枝云杉适应性强，生长迅速，在植树造林和工业用材方面占有重要地位，研究成果可为中国西南部亚高山天然林的可持续经营及退化生态系统的恢复与重建提供理论依据和科学指导。主要研究结果如下： 1．SSR位点变异丰富，等位基因频率的分布格局多样。7个SSR标记全是多态位点，每位点的等位基因数变化范围为13～24，平均为19.9个。SSR位点的等位基因片段长度范围变化较大。73.1％的等位基因变异遵循逐步突变模型（SSM）而发生1个重复基元的变化，22.3％和4.6％的变异分别按两阶段突变模型（TMP）发生1个重复基元以上的变化和在SSR位点侧翼区发生1个碱基变化的插入-删除事件。 2．粗枝云杉拥有中等偏高水平的遗传多样性和相当高的群体间遗传分化。通过分析代表10个群体的250个个体在7个SSR位点的变化，调查了源自中国西南山区的粗枝云杉的微卫星变异。相当高的遗传多样性和强烈的群体分化发生在粗枝云杉中，其群体平均Nei’s期望杂合度为0.707，群体间遗传距离为0.121～0.224(FST)和0.100～0.537(RST)。然而，群体间遗传距离与地理距离之间无相关性，从而排除了简单的距离分离模式并暗示迁移不是影响粗枝云杉遗传变异